应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】DS对接结果分析
181/1返回列表
查看: 6580  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】DS对接结果分析

应用DS做了一个对接的结果分析图片，但是自己看不懂呀？请教各位大侠了！

这些图片的不同颜色里面都包含了什么作用？氯原子下面蓝色的底纹代表什么？

201残基下的蓝色底纹代表什么呢？谢谢各位了，还有红紫色箭头代表氢键，我的配体能形成这么多氢键么？




[ Last edited by zhaoqingshan on 2011-1-18 at 12:35 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集 Discovery Studio 常见问题及使用教程 分子模拟

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-01-18 12:20:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wdali

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
zhaoqingshan(金币+5): 2011-01-18 21:31:25
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-01-19 16:41:59
紫色表示参与氢键、静电或极性相互作用的氨基酸
绿色表示参与范德华相互作用的氨基酸
绿色带阴影：氨基酸的溶剂可及表面以蓝色的中空圆覆盖在该氨基酸上。圆的半径大小与溶剂可及表面的大小成正比例。
蓝色箭头：与氨基酸侧链形成的氢键。箭头指向电子供体。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-01-18 14:46:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

myputer

铜虫 (初入文坛)

这个对接是怎么样做出来的用DS

这个对接是怎么样做出来的用DS
赞一下 回复此楼
3楼2011-01-18 16:33:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by wdali at 2011-01-18 14:46:44:
紫色表示参与氢键、静电或极性相互作用的氨基酸
绿色表示参与范德华相互作用的氨基酸
绿色带阴影：氨基酸的溶剂可及表面以蓝色的中空圆覆盖在该氨基酸上。圆的半径大小与溶剂可及表面的大小成正比例。
蓝色箭头 ...

氯原子下面蓝色的底纹代表什么？
苯环上面的两个蓝色底纹代表什么呢
赞一下 回复此楼
4楼2011-01-18 21:34:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wdali

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhaoqingshan at 2011-01-18 21:34:29:


氯原子下面蓝色的底纹代表什么？
苯环上面的两个蓝色底纹代表什么呢

这个我还真不知道耶，等我弄明白了，一定会来回答你
赞一下 回复此楼
5楼2011-01-20 10:31:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)
先谢谢了
回复此楼
6楼2011-01-20 19:28:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)
各位高手，还有谁能帮解释一下呀！
赞一下 回复此楼
7楼2011-01-23 20:08:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)
急急急急急急！自己再顶一下
赞一下 回复此楼
8楼2011-01-28 21:33:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)
★ ★ ★ ★
zhaoqingshan(金币+5): 2011-01-31 10:59:08
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-02-05 20:47:11
阴影表示溶剂化效应。

具体情况，看论文：
Alex M. Clark* and Paul Labute
2D Depiction of Protein Ligand Complexes
J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 1933-1944

作者就是出品MOE的CCG公司的。
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2011-01-29 09:01:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)
好的，谢谢了
回复此楼
10楼2011-01-31 11:30:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

britney137803

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
阴影是溶剂化效应？
这个挺有意思的~~
呵呵
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2011-02-02 16:02:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by britney137803 at 2011-02-02 16:02:42:
阴影是溶剂化效应？
这个挺有意思的~~
呵呵

您的意思是：是溶剂化效应，还是不是溶剂化效应呀？
赞一下 回复此楼
12楼2011-02-03 17:05:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Discovery Studio 常见问题及使用教程》
赞一下 回复此楼
13楼2011-09-05 19:53:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
赞一下 回复此楼
14楼2011-09-05 19:53:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zff2010

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主的对接用的是DS2.5吗？我做出来的只有结构没有相互作用力的显示啊，求解...谢谢！
赞一下 回复此楼
15楼2013-06-03 15:20:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisaw

新虫 (初入文坛)
溶剂效应
回复此楼
16楼2014-04-22 21:38:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ydfxzq

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，我想请教一下你这个2D图是怎么做出来的啊，我倒腾了半天一直有问题，求解决啊。
赞一下 回复此楼
17楼2015-05-20 10:35:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cun8209

捐助贵宾 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
您好，您的这样的图是怎么导出的啊，我怎么鼓捣都弄不出来，求指导啊
赞一下 回复此楼
18楼2019-01-11 11:12:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhaoqingshan 的主题更新
181/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 336求调剂 +4 收到VS 2026-03-20 4/200 2026-03-23 19:02 by macy2011
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap－ 2026-03-22 9/450 2026-03-23 12:57 by yqdszhdap－
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-18 6/300 2026-03-22 20:18 by edmund7
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +11 梨花珞晚风 2026-03-17 11/550 2026-03-22 17:42 by luoyongfeng
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +6 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 7/350 2026-03-21 01:03 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭