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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】DS对接结果分析

应用DS做了一个对接的结果分析图片，但是自己看不懂呀？请教各位大侠了！

这些图片的不同颜色里面都包含了什么作用？氯原子下面蓝色的底纹代表什么？

201残基下的蓝色底纹代表什么呢？谢谢各位了，还有红紫色箭头代表氢键，我的配体能形成这么多氢键么？

[ Last edited by zhaoqingshan on 2011-1-18 at 12:35 ]

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1楼 2011-01-18 12:20:34

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chemozhang

木虫 (正式写手)

模拟EPI: 1
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在线: 356小时
虫号: 282954

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》

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14楼2011-09-05 19:53:43

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wdali

金虫 (正式写手)

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虫号: 779440

★ ★ ★
zhaoqingshan(金币+5): 2011-01-18 21:31:25
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-01-19 16:41:59

紫色表示参与氢键、静电或极性相互作用的氨基酸
绿色表示参与范德华相互作用的氨基酸
绿色带阴影：氨基酸的溶剂可及表面以蓝色的中空圆覆盖在该氨基酸上。圆的半径大小与溶剂可及表面的大小成正比例。
蓝色箭头：与氨基酸侧链形成的氢键。箭头指向电子供体。

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2楼2011-01-18 14:46:44

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myputer

铜虫 (初入文坛)

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金币: 25.3
帖子: 24
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虫号: 903953

这个对接是怎么样做出来的用DS

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3楼2011-01-18 16:33:01

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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)

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在线: 8.1小时
虫号: 911121

引用回帖:

Originally posted by wdali at 2011-01-18 14:46:44:
紫色表示参与氢键、静电或极性相互作用的氨基酸
绿色表示参与范德华相互作用的氨基酸
绿色带阴影：氨基酸的溶剂可及表面以蓝色的中空圆覆盖在该氨基酸上。圆的半径大小与溶剂可及表面的大小成正比例。
蓝色箭头 ...

氯原子下面蓝色的底纹代表什么？
苯环上面的两个蓝色底纹代表什么呢

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4楼2011-01-18 21:34:29

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