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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)


[交流] 【求助】DS对接结果分析

应用DS做了一个对接的结果分析图片,但是自己看不懂呀?请教各位大侠了!

这些图片的不同颜色里面都包含了什么作用?氯原子下面蓝色的底纹代表什么?

201残基下的蓝色底纹代表什么呢?谢谢各位了,还有红紫色箭头代表氢键,我的配体能形成这么多氢键么?





[ Last edited by zhaoqingshan on 2011-1-18 at 12:35 ]
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wdali

金虫 (正式写手)


★ ★ ★
zhaoqingshan(金币+5): 2011-01-18 21:31:25
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-01-19 16:41:59
紫色表示参与氢键、静电或极性相互作用的氨基酸
绿色表示参与范德华相互作用的氨基酸
绿色带阴影:氨基酸的溶剂可及表面以蓝色的中空圆覆盖在该氨基酸上。圆的半径大小与溶剂可及表面的大小成正比例。
蓝色箭头:与氨基酸侧链形成的氢键。箭头指向电子供体。
2楼2011-01-18 14:46:44
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myputer

铜虫 (初入文坛)


这个对接是怎么样做出来的用DS

这个对接是怎么样做出来的用DS
3楼2011-01-18 16:33:01
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by wdali at 2011-01-18 14:46:44:
紫色表示参与氢键、静电或极性相互作用的氨基酸
绿色表示参与范德华相互作用的氨基酸
绿色带阴影:氨基酸的溶剂可及表面以蓝色的中空圆覆盖在该氨基酸上。圆的半径大小与溶剂可及表面的大小成正比例。
蓝色箭头 ...

氯原子下面蓝色的底纹代表什么?
苯环上面的两个蓝色底纹代表什么呢
4楼2011-01-18 21:34:29
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wdali

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by zhaoqingshan at 2011-01-18 21:34:29:


氯原子下面蓝色的底纹代表什么?
苯环上面的两个蓝色底纹代表什么呢

这个我还真不知道耶,等我弄明白了,一定会来回答你
5楼2011-01-20 10:31:27
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)


先谢谢了
6楼2011-01-20 19:28:49
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)


各位高手,还有谁能帮解释一下呀!
7楼2011-01-23 20:08:20
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)


急急急急急急!自己再顶一下
8楼2011-01-28 21:33:05
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★ ★ ★ ★
zhaoqingshan(金币+5): 2011-01-31 10:59:08
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-02-05 20:47:11
阴影表示溶剂化效应。

具体情况,看论文:
Alex M. Clark* and Paul Labute
2D Depiction of Protein Ligand Complexes
J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 1933-1944

作者就是出品MOE的CCG公司的。
9楼2011-01-29 09:01:00
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)


好的,谢谢了
10楼2011-01-31 11:30:15
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britney137803

至尊木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
阴影是溶剂化效应?
这个挺有意思的~~
呵呵
11楼2011-02-02 16:02:42
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by britney137803 at 2011-02-02 16:02:42:
阴影是溶剂化效应?
这个挺有意思的~~
呵呵

您的意思是:是溶剂化效应,还是不是溶剂化效应呀?
12楼2011-02-03 17:05:13
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chemozhang

木虫 (正式写手)


帖子真精彩!
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13楼2011-09-05 19:53:39
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chemozhang

木虫 (正式写手)


帖子真精彩!
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14楼2011-09-05 19:53:43
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zff2010

铁虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主的对接用的是DS2.5吗?我做出来的只有结构没有相互作用力的显示啊,求解...谢谢!
15楼2013-06-03 15:20:31
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lisaw

新虫 (初入文坛)


溶剂效应
16楼2014-04-22 21:38:10
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ydfxzq

银虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,我想请教一下你这个2D图是怎么做出来的啊,我倒腾了半天一直有问题,求解决啊。
17楼2015-05-20 10:35:13
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cun8209

捐助贵宾 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
您好,您的这样的图是怎么导出的啊,我怎么鼓捣都弄不出来,求指导啊
18楼2019-01-11 11:12:56
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