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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】DS对接结果分析
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】DS对接结果分析

应用DS做了一个对接的结果分析图片，但是自己看不懂呀？请教各位大侠了！

这些图片的不同颜色里面都包含了什么作用？氯原子下面蓝色的底纹代表什么？

201残基下的蓝色底纹代表什么呢？谢谢各位了，还有红紫色箭头代表氢键，我的配体能形成这么多氢键么？




[ Last edited by zhaoqingshan on 2011-1-18 at 12:35 ]
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1楼2011-01-18 12:20:34
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by britney137803 at 2011-02-02 16:02:42:
阴影是溶剂化效应？
这个挺有意思的~~
呵呵

您的意思是：是溶剂化效应，还是不是溶剂化效应呀？
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12楼2011-02-03 17:05:13
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wdali

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
zhaoqingshan(金币+5): 2011-01-18 21:31:25
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-01-19 16:41:59
紫色表示参与氢键、静电或极性相互作用的氨基酸
绿色表示参与范德华相互作用的氨基酸
绿色带阴影：氨基酸的溶剂可及表面以蓝色的中空圆覆盖在该氨基酸上。圆的半径大小与溶剂可及表面的大小成正比例。
蓝色箭头：与氨基酸侧链形成的氢键。箭头指向电子供体。
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2楼2011-01-18 14:46:44
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myputer

铜虫 (初入文坛)

这个对接是怎么样做出来的用DS

这个对接是怎么样做出来的用DS
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3楼2011-01-18 16:33:01
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zhaoqingshan

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by wdali at 2011-01-18 14:46:44:
紫色表示参与氢键、静电或极性相互作用的氨基酸
绿色表示参与范德华相互作用的氨基酸
绿色带阴影：氨基酸的溶剂可及表面以蓝色的中空圆覆盖在该氨基酸上。圆的半径大小与溶剂可及表面的大小成正比例。
蓝色箭头 ...

氯原子下面蓝色的底纹代表什么？
苯环上面的两个蓝色底纹代表什么呢
赞一下 回复此楼
4楼2011-01-18 21:34:29
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