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段家一凡

木虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
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虫号: 935596

[交流] 【求助/交流】做一个蛋白质晶体的成本是多少？

我有一个新的家族的一个蛋白，想测它的三维结构，因为以前没有做过，想问问做出一个蛋白的结构大概要多少钱？我的蛋白小于200个氨基酸，应该也可以用核磁共振来测，不知有没有人知道分别用X-衍射和核磁共振各需要多少money？

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1楼 2011-01-06 10:32:37

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月月大可

木虫 (著名写手)

BioEPI: 2
应助: 13 (小学生)
金币: 3272.1
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虫号: 549127

段家一凡(金币+5): 非常感谢 2011-01-26 16:06:12

偶在生物物理所做结构做了快两年，简单说一下我的看法吧

想做结构一般的具有两个条件：
1、软件：是否具备结构生物学知识。包括晶体学内容和后期结构修正的基础。这需要有很多专业软件去运算。软件的使用和参数的评估是结构修正中最重要的工作。
2、硬件：包括蛋白质纯化、结晶条件搜索、晶体优化和最后的衍射。这都需要配套的仪器和试剂。很多试剂适合长期做的买，单独做一次买一个kit太亏，kit也太贵。

然后我们来看你的蛋白。
首先建议在pdb数据库中比对一下，看看有没有同源蛋白结构已经被解析了。不见得是新家族功能上就全新，可能核心区域很相似。
蛋白小是件好事，一般来说小的会比大的容易一些。
长晶体一般需要大量高纯度的具备生物活性目的蛋白，能不能获得如此高要求的蛋白是第一道门槛。
过了这一关能不能长出晶体又是一关，有些人做的顺利几周就能过了这一关，我属于不顺的人，做了一年多还没能长出来晶体。
然后是晶体长出来后能不能筛选出来适合衍射条件的晶体又是一个难度，同样看运气了。
晶体可以衍射以后确定相角还是一个难度，如果有同源度较高的蛋白，那么用分子置换法能确定，如果没有使用重原子或者硒代甲硫氨酸了。
最后是解结构了，还是运气，顺了那么三两下就出来，不顺…………
我只对X-ray了解这么多，NMR不了解，请其他人介绍吧。

钱没法给你估计。如果没有结构生物学的基础更加建议寻求合作路线（个人观点）。

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4楼2011-01-19 14:00:17

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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

★
最爱花诗雨(金币+1):谢谢交流 2011-01-06 11:00:56
段家一凡(金币+3):非常感谢 2011-01-06 20:24:36

不是用钱来衡量的，得看具体的难易程度。我们老板在美国的时候做一个蛋白花了六年时间，花了大概几十万美金吧。

容易一点的蛋白，一套做下来周期是 30-90天，花费数万。

困难一点的，比如膜蛋白，做出来就是NSC的文章，据说施一公他们每年买去垢剂的钱就是上百万。

我说的是X-ray。核磁没做过，具体不清楚。

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2楼2011-01-06 10:43:48

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