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【求助/交流】核基因 PCR产物直接测序,结果出现单个位点套峰,是否需要做克隆测序
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逸如风
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[交流]
【求助/交流】核基因 PCR产物直接测序,结果出现单个位点套峰,是否需要做克隆测序
如题,核基因PCR产物直接测序,测序结果出现单个位点套峰,是否需要做克隆测序?我是要得到基因序列做分析,没有后续的实验。套峰位点两个碱基都很清楚,很有可能是杂合子,但是不知道能不能排除测序结果错误的可能性。求高手指点!!
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2010-12-27 11:13:03
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逸如风
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Originally posted by
susizheng
at 2010-12-27 13:49:03:
做下克隆吧,多测几个不同的克隆,看是否是测序误差,
不过如果是杂合子的话,不一定能保证能测两个有差异的克隆。
经验上测序是不是要挑取10个菌落?如果这样的话测序成本超出预期了。测序误差是可能存在的是吧?
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9楼
2010-12-29 09:41:40
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susizheng
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逸如风(金币+1):谢谢!就是说还是有测序误差的可能性咯? 2010-12-27 17:31:50
做下克隆吧,多测几个不同的克隆,看是否是测序误差,
不过如果是杂合子的话,不一定能保证能测两个有差异的克隆。
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2楼
2010-12-27 13:49:03
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amilie030312
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逸如风(金币+1):谢谢! 2010-12-27 17:32:08
你用的PCR的酶保真性不好,换个酶吧,你这PCR之后出现套峰了肯定是出现错配了
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3楼
2010-12-27 15:13:06
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rioarsenal
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逸如风(金币+1):歇息 2010-12-29 09:39:02
那个密码子对应的氨基酸变了没?
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4楼
2010-12-27 15:18:22
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