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mars20081587

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】DGGE遇到了难题,向大家求助!已有6人参与

最近在做水体里细菌的V3区DGGE,引物是341f-GC和907r(参考国内外文献),我把同一个DNA模板用了不同的PCR方法跑琼脂糖电泳胶,求得最好的方法,然后用这些PCR产物跑DGGE胶,40%-64%,6%胶,明明PCR条带很亮,可是DGGE的条带却都不清晰,请教各位高手,希望能得到解答,第一张图片是PCR的图,第二张是DGGE的图。

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xiadongliang

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
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Originally posted by tsq0126 at 2011-01-06 14:54:23:




这两个图是我的V3片段的PCR产物和DGGE的结果,同学相信你的问题已经解决了吧,我现在也遇到瓶颈啦,希望得到你的帮助。

什么染色方法啊?EB还是银染?
5楼2011-01-07 14:48:02
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xiadongliang

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by tsq0126 at 2011-01-08 14:06:02:




做胶的各种试剂是从上海生工买的,很多人建议用SIGMA的,不过我们做的不多,买进口的太贵了,就买了国产的了。
制胶过程有什么需要特别注意的地方吗?

338F  518R这个引物是没有问题的。用的也比较广泛。

染色方法仔细分析一下吧。
目前比较常用的方法还是银染。
9楼2011-01-09 14:27:44
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