应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助完毕】vasp-slab-边界附近原子顶位吸附小分子的结构优化很难收敛吗？
51/1返回列表
查看: 1987  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

[交流] 【求助完毕】vasp-slab-边界附近原子顶位吸附小分子的结构优化很难收敛吗？

我的表面是p(3*3)大小的，在表面中间吸附、掺杂都能100步内收敛。但是在靠近边界的最表层原子顶位上的吸附（如吸附SO2）结构,力就很难收敛，都300多步了，而且能量在小数点后第三位上上下波动。

同样在边界附近去掉一个最表层原子（O），做一个空位结构，也能较快收敛。但同一系列的自洽计算（ISMEAR=0,SIGMA=0.05）,scf的EENTRO~=.03。一般中间缺陷或者吸附结构在scf计算中第六电子步就是0.0000了。

问题：
（1）边界上的缺陷和吸附结构优化有什么要注意的呢？
（2）要增大表面大小，把边界外推，让吸附结构靠近表面中心？
（3）超胞结构优化（cell fixed)边界与表面中心的处理不一样吗？

[ Last edited by cenwanglai on 2011-4-25 at 20:13 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VASP 杂七杂八

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-13 16:17:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2010-12-13 21:09:26:
如果有图会比较容易理解，你的表面是周期边界条件的吗？边界是指在cell的边界处吗？
按我的理解，在边界处的计算应该和中心计算没有太多的区别，唯一可能的原因就是原子一离开cell就会做一个加法或减法回到cell， ...

是周期性边界条件。你完全明白了我的问题所在。

我的POTIM调到0.1了。是不是可以再调小一点？
赞一下 回复此楼
3楼2010-12-14 09:10:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

bingmou

金虫 (著名写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2):鼓励交流 2010-12-13 22:59:04
如果有图会比较容易理解，你的表面是周期边界条件的吗？边界是指在cell的边界处吗？
按我的理解，在边界处的计算应该和中心计算没有太多的区别，唯一可能的原因就是原子一离开cell就会做一个加法或减法回到cell，这种加法减法可能会导致误差。
顶位的吸附也是一个问题，有可能会有多个暂稳态使得原子在多个暂稳态之间跳跃
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-12-13 21:09:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-14 09:17:37
cenwanglai(金币+2):是氧化物表面。中间是有杂原子的。除此之外，没有差别。杂原子对表面有一定扭曲。 2010-12-14 11:28:57
氧化物表面么？

能确定边界和中心的环境是一样的么？
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-12-14 09:16:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-12-14 09:33:26
cenwanglai(金币+2):表面被吸附的小分子受力无法收敛。其它结构能很好的收敛到0.02.边界附近吸附势只能到0.05. 2010-12-14 11:30:14
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-12-14 09:10:04:


是周期性边界条件。你完全明白了我的问题所在。

我的POTIM调到0.1了。是不是可以再调小一点？

我觉得你可以仔细研究是一下是哪些原子的力无法收敛，以及他们为什么在那里无法收敛。POTIM已经很小了，我觉得没有必要修改，而且VASP在弛豫的过程中是修改POTIM的，如果发现不对会缩小POTIM，如果发现正确会加大POTIM
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-12-14 09:24:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 311求调剂 +13 冬十三 2026-03-15 14/700 2026-03-21 22:10 by peike
[考研] 0805 316求调剂 +3 大雪深藏 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:55 by 学员8dgXkO
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 298求调剂 +4 上岸6666@ 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:14 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +6 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 7/350 2026-03-21 01:03 by JourneyLucky
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:35 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 3/150 2026-03-20 11:58 by 呱呱呱呱叫
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考研] 一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂 +10 Liwangman 2026-03-15 10/500 2026-03-19 10:25 by 无际的草原
[考研] 材料专硕306英一数二 +10 z1z2z3879 2026-03-16 13/650 2026-03-18 14:20 by 007_lilei
[考研] 0854，计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 一志愿，福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭