24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2116  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ouczhouyi

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】如何合并文件 pdb psf 已有3人参与

因为vmd中solvate只能加一次水,请教高手,说单独造一个水盒子,再合并一下文件就行,但不知如何操作,要是复制起来好像非常麻烦,故请教大家了,谢谢了
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

和毕设有关的 分子模拟 gromacs

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
加几次水都没问题。注意用个以前没用过的segname就行了。

合并两个文件也要没有相同的segname
4楼2010-12-03 11:59:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

leewz922

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
没听明白您的意思,详细说下你想怎么做?
2楼2010-12-02 21:04:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ouczhouyi

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by leewz922 at 2010-12-02 21:04:43:
没听明白您的意思,详细说下你想怎么做?

就是将单独造的两个模型,合并到一起,也就是pdb psf文件的合并
3楼2010-12-03 11:16:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leewz922

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-03 22:48:45
把两个pdb做为两个segment,调用VMD的psfgen,把坐标读入,然后输出的时候,就能把这两个都写到一块了。你可以看看如何制作psf文件的教程,应该能解决你想要解决的问题。

[ Last edited by leewz922 on 2010-12-3 at 19:47 ]
5楼2010-12-03 19:46:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 08工学 309分求调剂 +6 Yin DY 2026-04-08 6/300 2026-04-10 09:18 by Delta2012
[考研] 085601初试330分找调剂 +10 流心奶黄包l 2026-04-09 10/500 2026-04-10 08:14 by Sammy2
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +16 ioodiiij 2026-04-08 16/800 2026-04-09 23:08 by wolf97
[考研] 314求调剂 +16 xhhdjdjsjks 2026-04-09 17/850 2026-04-09 18:26 by 喝醉酒N
[硕博家园] 有没有学校材料专业收跨调(一志愿085410) +5 momo(上岸版) 2026-04-06 8/400 2026-04-09 15:07 by only周
[考研] 307求调剂 +14 超级伊昂大王 2026-04-06 14/700 2026-04-08 07:03 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +15 熊二想上岸 2026-04-06 15/750 2026-04-08 04:53 by 无际的草原
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南090202求调剂 +4 在线求有学上 2026-04-07 4/200 2026-04-07 19:47 by biomichael
[考研] 277工科求调剂 +10 1915668 2026-04-04 11/550 2026-04-06 23:53 by 心媛意北
[考研] 考研调剂 +7 15615482637 2026-04-04 7/350 2026-04-06 22:56 by chenzhimin
[考研] 071000生物学调剂 +7 拉提桃 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:55 by 52305043001
[考研] 285求调剂 +5 mapmath 2026-04-06 6/300 2026-04-06 17:18 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +4 wos666 2026-04-03 5/250 2026-04-06 15:22 by wos666
[考研] 362求调剂一志愿中国石油大学 +4 我要考大 2026-04-06 6/300 2026-04-06 14:11 by 无际的草原
[考研] 一志愿武汉理工大学080200机械工程308分,求调剂 +4 终不似从前 2026-04-05 4/200 2026-04-06 11:46 by 考研学校招点人
[考研] 277求调剂 +5 考研调剂lxh 2026-04-05 5/250 2026-04-05 19:03 by chy09050039
[考研] 326求调剂 +3 顾若浮生 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:32 by 蓝云思雨
[考研] 321求调剂 +6 认真求上学 2026-04-03 6/300 2026-04-04 19:51 by dongzh2009
[考研] 材料383求调剂 +5 郭阳阳阳成 2026-04-04 5/250 2026-04-04 19:06 by dongzh2009
信息提示
请填处理意见