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ouczhouyi

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[交流] 【求助】如何合并文件 pdb psf 已有3人参与

因为vmd中solvate只能加一次水，请教高手，说单独造一个水盒子，再合并一下文件就行，但不知如何操作，要是复制起来好像非常麻烦，故请教大家了，谢谢了

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1楼 2010-12-01 20:43:33

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ouczhouyi

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引用回帖:

Originally posted by leewz922 at 2010-12-02 21:04:43:
没听明白您的意思，详细说下你想怎么做？

就是将单独造的两个模型，合并到一起，也就是pdb psf文件的合并

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3楼2010-12-03 11:16:54

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leewz922

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没听明白您的意思，详细说下你想怎么做？

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2楼2010-12-02 21:04:43

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wally8962

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加几次水都没问题。注意用个以前没用过的segname就行了。

合并两个文件也要没有相同的segname

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4楼2010-12-03 11:59:13

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leewz922

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zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-03 22:48:45

把两个pdb做为两个segment，调用VMD的psfgen，把坐标读入，然后输出的时候，就能把这两个都写到一块了。你可以看看如何制作psf文件的教程，应该能解决你想要解决的问题。

[ Last edited by leewz922 on 2010-12-3 at 19:47 ]

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5楼2010-12-03 19:46:44

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