| 查看: 1207 | 回复: 8 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】amber并行安装测试出错（总感觉论坛越来越冷清了-_-!）
|
|||
|
amber并行安装测试出错，前面串行安装非常顺利，make parallel也显示并行安装完成，但是并行测试始终通不过 make test.parallel.MM < /dev/null： export TESTsander=/share/apps/amber10/exe/sander.MPI; make test.sander.BASIC make[1]: Entering directory `/share/apps/amber10/test' cd cytosine && ./Run.cytosine [cluster:07680] *** Process received signal *** [cluster:07680] Signal: Segmentation fault (11) [cluster:07680] Signal code: Address not mapped (1) [cluster:07680] Failing at address: 0x50 [cluster:07680] [ 0] /lib64/libpthread.so.0 [0x357dc0e7c0] [cluster:07680] [ 1] /opt/openmpi/lib/libopen-rte.so.0(orte_util_encode_pidmap+0xdb) [0x2b4d87bb25eb] [cluster:07680] [ 2] /opt/openmpi/lib/libopen-rte.so.0(orte_odls_base_default_get_add_procs_data+0x598) [0x2b4d87bc91b8] [cluster:07680] [ 3] /opt/openmpi/lib/libopen-rte.so.0(orte_plm_base_launch_apps+0x10b) [0x2b4d87bd82bb] [cluster:07680] [ 4] /opt/openmpi/lib/libopen-rte.so.0 [0x2b4d87bdc9d4] [cluster:07680] [ 5] mpirun [0x403246] [cluster:07680] [ 6] mpirun [0x402923] [cluster:07680] [ 7] /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf4) [0x357d01d994] [cluster:07680] [ 8] mpirun [0x402859] [cluster:07680] *** End of error message *** Segmentation fault ./Run.cytosine: Program error make[1]: *** [test.sander.BASIC] Error 1 make[1]: Leaving directory `/share/apps/amber10/test' make: *** [test.sander.BASIC.MPI] Error 2 好心人说可能是openmpi的版本问题，然后我就试了5个版本，没有一个测试通过的，当换到openmpi-1.2.9，索性make parallel都过不去了，请问该怎么办啊？？？？？ 欢迎各位发表意见，不胜感激！希望这个帖子不要又是石沉大海～ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有7人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有8人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有10人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
厉娜
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- VASP并行计算出错
已经有9人回复
- amber 保存复合物时出错
已经有3人回复
- 求助AMBER10的安装指导，拜托各位，感谢
已经有7人回复
- Amber tools 中的antechamber 必须要在安装了amber11的前体下才能使用么?
已经有4人回复
- 并行WIEN2K安装失败，如何解决，谢谢！
已经有9人回复
- vasp并行测试时出错。
已经有7人回复
- cp2k并行编译出错
已经有3人回复
- vasp 并行运算出错
已经有7人回复
- 请问MS-linux-cluster安装之后无法并行的问题？
已经有5人回复
- 【求助】AMBER11安装问题
已经有5人回复
- 【ghcacj个人文集】单机环境下安装openmpi使用Orca并行运算的方法介绍
已经有12人回复
- 【求助】amber10安装，有关MKL和blas库的疑问
已经有3人回复
- 【求助】mkl+ifort+openmpi+siesta3.并行安装出错
已经有8人回复
7楼2010-11-28 11:12:48
3楼2010-11-26 20:11:31
4楼2010-11-27 07:58:38
5楼2010-11-27 09:06:45
