24小时热门版块排行榜    

查看: 3688  |  回复: 10

駱寒

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】几个序列的拼接 已有9人参与

请问有人知道用什么软件可以实现不同序列的拼接吗?有人告诉我说bioedit可以,但我不会用,求教。
我的是rbcl片段和trnL-F片段,还有psbA片段,每个测了40个样品,现在希望把个样品的三个片段拼接起来一起分析,求教具体操作。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

我不懒
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王会征

铁杆木虫 (著名写手)

普通的DNAman软件就可以实现拼接功能啊,关键是找好序列的连接点即重叠区域。
2楼2010-10-14 11:42:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

駱寒

银虫 (小有名气)

不是这个意思,是要把这几个片段连在一起。
我不懒
3楼2010-10-14 12:14:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

带刀猎人

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk:那个软件有那么厉害? 2010-10-14 18:32:17
DNAstar,拼接,分析,构建进化树等七合一软件包,实乃居家旅行杀人必备之佳品!
4楼2010-10-14 16:16:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biofuture

铁虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):说的很在理 2010-10-14 18:32:43
cap3 可以拼接, 我掘得你做这个事的时候,应该把所有能拼接的软件 以及他们的文献都给找到, 比较一下, 找到一个最合适的 , 而不是在这里问别人。   这种搜索能力是做科研必备。
年轻人就应该奋斗
5楼2010-10-14 17:49:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lu_zl

银虫 (小有名气)

DNAMAN有专门的sequence assembly功能。
6楼2010-10-14 19:48:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1949stone

荣誉版主 (知名作家)

海纳百川


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
对比一下 直接拼接
海纳百川止于至善
7楼2010-10-14 20:13:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖仅楼主可见
8楼2012-09-25 04:02:54
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

51chuguo

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主的意思是将三个基因按顺序一个个前后连接起来,不是将一个基因两端测序后,拼接起来。
在BioEdit中打开一个序列,然后将序列上方的一个菜单:Mode下拉式菜单改为Edit,将光标移动到序列的最末端,从粘贴板上粘贴你要增加的第二个序列即可。这样三个序列都前后连接到一起了。
这需要一个一个来,十分麻烦。Mega5软件支持将比对后的序列一下子全部放到另外一个比对后的序列后面。因此在序列连接(或拼接)中,用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做连接时,要选择Edit/Build alignment,不能是Edit/view选项,否则不能编辑。

[ Last edited by 51chuguo on 2012-11-25 at 10:38 ]
9楼2012-11-25 09:51:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

122301692

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by 51chuguo at 2012-11-25 09:51:29
楼主的意思是将三个基因按顺序一个个前后连接起来,不是将一个基因两端测序后,拼接起来。
在BioEdit中打开一个序列,然后将序列上方的一个菜单:Mode下拉式菜单改为Edit,将光标移动到序列的最末端,从粘贴板上粘 ...

51chuguo前辈,能不能说一下具体操作啊?谢谢啦
10楼2014-01-09 12:56:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 駱寒 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +6 gjjjzhong 2026-08-18 7/350 2026-08-18 12:48 by laoda193707
[硕博家园] 读博的好处 +5 lnee 2026-08-11 5/250 2026-08-18 12:32 by 学员tGYWa5
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +44 医学老男孩 2026-08-13 98/4900 2026-08-18 12:14 by wenky
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 8/400 2026-08-18 11:47 by gltch
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 5/250 2026-08-18 11:25 by 無關想念
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +5 基诺咪客 2026-08-17 6/300 2026-08-18 11:06 by hunter无悔
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见