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駱寒

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 118.7
帖子: 108
在线: 20.9小时
虫号: 918839
注册: 2009-12-02
性别: MM
专业: 植物分类学

[交流] 【求助/交流】几个序列的拼接已有9人参与

请问有人知道用什么软件可以实现不同序列的拼接吗？有人告诉我说bioedit可以，但我不会用，求教。
我的是rbcl片段和trnL-F片段，还有psbA片段，每个测了40个样品，现在希望把个样品的三个片段拼接起来一起分析，求教具体操作。

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我不懒

1楼2010-10-14 11:01:06

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51chuguo

木虫 (正式写手)

应助: 6 (幼儿园)
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虫号: 439570
注册: 2007-10-15
专业: 微生物资源与分类学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

楼主的意思是将三个基因按顺序一个个前后连接起来，不是将一个基因两端测序后，拼接起来。
在BioEdit中打开一个序列，然后将序列上方的一个菜单：Mode下拉式菜单改为Edit，将光标移动到序列的最末端，从粘贴板上粘贴你要增加的第二个序列即可。这样三个序列都前后连接到一起了。
这需要一个一个来，十分麻烦。Mega5软件支持将比对后的序列一下子全部放到另外一个比对后的序列后面。因此在序列连接（或拼接）中，用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做连接时，要选择Edit/Build alignment，不能是Edit/view选项，否则不能编辑。

[ Last edited by 51chuguo on 2012-11-25 at 10:38 ]