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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】引物设计需验证吗？
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lhm_hnyj

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】引物设计需验证吗？ 已有5人参与

小虫下了Primer 5，鼓捣了很久才可以运行起来，都还不会用呢。结果刚又听说不要自己设计，否则发文章的时候需要验证，全世界买菌种来验证自己的引物是可行的，工作量相当的大，弄得我很是纠结啊。我现在只是想通过已有的同属几个品种的序列设计特异引物，将这几个种加以鉴别，而文献报道的大多是用通用引物进行扩增，大家能给小虫些建议吗，到底该不该自己设计引物，真的需大量验证吗？
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1楼 2010-09-17 09:36:22
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green1223

木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
怎么没人回答？？？？、
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2楼2010-09-18 22:30:02
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sfxt001

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你说的是什么引物啊？16S的？
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3楼2010-09-18 22:46:49
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lhm_hnyj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by sfxt001 at 2010-09-18 22:46:49:
你说的是什么引物啊？16S的？

是真菌ITS的
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4楼2010-09-19 08:28:23
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魑魅-魍魉

新虫 (正式写手)
外面去设计引物又不贵，方便经济又实惠，错误少效果少，楼主何必呢，不过你想设计没人拦得住啊，对吧？！ 按照自己的意愿走呗
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风中摇曳的颤枝，何处是归根？
5楼2010-09-19 08:56:49
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lhm_hnyj

金虫 (小有名气)
[quote]Originally posted by 魑魅-魍魉 at 2010-09-19 08:56:49:
外面去设计引物又不贵，方便经济又实惠，错误少效果少，楼主何必呢，不过你想设计没人拦得住啊，对吧？！ 按照自己的意愿走呗 [/quo
呵呵，我想您是误解我的意思了，也难怪，因为我们学化学出身，现在实验室基本就是我一个人，带我的老师基本不去，也是学植化的，老以为这些必须是自己来干的。稍微咨询了下公司，说是可以免费设计，这下我可乐坏了
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6楼2010-09-19 20:56:17
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魑魅-魍魉

新虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by lhm_hnyj at 2010-09-19 20:56:17:
[quote]Originally posted by 魑魅-魍魉 at 2010-09-19 08:56:49:
外面去设计引物又不贵，方便经济又实惠，错误少效果少，楼主何必呢，不过你想设计没人拦得住啊，对吧？！ 按照自己的意愿走呗 [/quo
呵 ...

那可真是恭喜楼主了，我们都是老师直接联系的。祝你早日出成果
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风中摇曳的颤枝，何处是归根？
7楼2010-09-20 07:07:21
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xiaoyu1014126

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by lhm_hnyj at 2010-09-17 09:36:22:
小虫下了Primer 5，鼓捣了很久才可以运行起来，都还不会用呢。结果刚又听说不要自己设计，否则发文章的时候需要验证，全世界买菌种来验证自己的引物是可行的，工作量相当的大，弄得我很是纠结啊。我现在只是想通过 ...

拿引物扩一下，大小片段对了，再测序下，比对一下，就OK了啊
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8楼2010-09-23 13:53:40
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green1223

木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xiaoyu1014126 at 2010-09-23 13:53:40:


拿引物扩一下，大小片段对了，再测序下，比对一下，就OK了啊

你是说拿引物PCR后，跑电泳，完了再测一下序吗
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9楼2010-09-23 14:06:39
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xiaoyu1014126

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by green1223 at 2010-09-23 14:06:39:

你是说拿引物PCR后，跑电泳，完了再测一下序吗

是的，因为电泳只能说明片段大小，测序说明你的引物的特异性
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10楼2010-09-24 08:59:18
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