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aidelingyu

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】分子动力学模拟尺度问题? 已有6人参与

本人初学分子模拟,想请教各位大侠,分子动力学最大模拟尺度是多少?看文献说时间尺度是纳秒级,一般空间尺度是多少?时间尺度能模拟的更长嘛?
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lei0736

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+5):谢谢Lei版主的解答 2010-09-14 10:16:38
如MD 看你的机器配置了 LANL有人做过上百亿原子的
时间一般是纳秒 上千纳秒不就是微秒级别了
不过要看看有没必要做到这个时间 空间 尺度
有的事件在皮秒 纳秒内就发生了 有必要跑到微秒吗?
有的事件在宏观时间尺度内才能完成 显然用MD是不行的
其次空间尺度的问题 如果是周期体系显然不用上亿原子
具体问题具体分析

MC模拟就没有时间限制 仅仅从热力学考虑 当然也就在动力学方面有欠缺
KMC在MC的基础上增加了时间关联 模拟的时间空间尺度大为扩展 但是也有一些固有缺点 对复杂过程的处理棘手
2楼2010-09-14 09:52:32
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lei0736

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-09-14 17:57:41
这么复杂的过程 应该可以分成几个阶段吧 也许要用到多种模拟方法 同时考虑各种近似  建立相应的物理模型 很难有某种方法适应你所说的过程 考虑到这么多细节及影响因素 全程模拟并得到合理的结果 这种工作量应该超出一般博士论文的内容
7楼2010-09-14 13:35:17
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