24小时热门版块排行榜    

查看: 3720  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fuel

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】vasp用neb计算过渡态报错,错误提示是什么意思?

在vasp中neb方法计算过渡态,用Vasp TST Tools。使用了8个image。计算了一天半之后报错如下,请帮忙看是什么原因,怎么改进。

forrtl: Socket operation on non-socket
forrtl: severe (38): error during write, unit 8, file /home/00to09/05/OUTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp-neb           000000000073F8FD  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           000000000073E405  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           000000000068334F  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          000000343441D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           0000000000438299  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (28): CLOSE error, unit 20, file "Unknown"
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp-neb           0000000000682B82  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           00000000006C896B  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           0000000000CE9C07  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          000000343441D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           0000000000438299  Unknown               Unknown  Unknown
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 4 with PID 14985 on
node node25 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsh1986914

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
恩,本人现在正在考虑换一个mpich重装试试
10楼2011-10-27 15:06:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

fuel

铁虫 (小有名气)

看来这是个生僻的问题。希望这个坑将来有人来填一下。
2楼2010-08-12 10:34:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsh1986914

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
我现在也在搞这个,也出现一大堆问题。我出现的问题也是莫名奇妙
[node14:19293] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19295] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19295] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[node14:19295] *** MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[node14:19295] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (goodbye)
[node14:19293] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[node14:19293] *** MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[node14:19293] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (goodbye)
[node14:19294] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19294] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[node14:19294] *** MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[node14:19294] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (goodbye)
[node14:19297] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19297] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[node14:19297] *** MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[node14:19297] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (goodbye)
[node14:19298] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19298] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[node14:19298] *** MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[node14:19298] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (goodbye)
[node14:19299] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19299] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[node14:19299] *** MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[node14:19299] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (goodbye)
[node14:19300] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19300] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[node14:19300] *** MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[node14:19300] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (goodbye)
[node14:19296] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19296] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[node14:19296] *** MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[node14:19296] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (goodbye)
也纠结
3楼2011-10-25 10:51:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnuzhoulin

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-10-25 20:51:14
forrtl: severe (38): error during write, unit 8, file /home/00to09/05/OUTCAR
如果这个提示是原因,是不是磁盘满了?或者quota到了限定值?

因为毕竟已经开始计算了那么久,或者如果是集群,也有能是网络问题
4楼2011-10-25 19:12:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 8/400 2026-09-01 12:58 by ssyjh
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 15/750 2026-09-01 12:23 by icm639
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
请填处理意见