| 查看: 2790 | 回复: 5 | |||
[求助]
vasp并行问题及NEB计算出错
|
|||
|
大家好！最近使用vasp遇到了奇怪的问题： （1）我的vasp是用mpif90编译的，然后递交任务的脚本也使用的是并行计算，脚本如下： #!/bin/bash #PBS -q normal #PBS -l nodes=32 #PBS -N siNF #PBS -l walltime=50:00:00 #PBS -o $PBS_JOBID.output module load intel-mvapich2-1.5 ulimit -s unlimited cd $PBS_O_WORKDIR mpiexec -n 32 vasp 任务是正常运行的，我用qstat看了，也是在32个节点上跑，可是最后的OUTCAR里面却显示的是串行版本，如下： vasp.5.2.2 15Apr09 complex executed on LinuxIFC date 2012.01.17 12:01:20 serial version （2）我把NEB编译到vasp里面后，运行出现如下错误： ERROR: the following files does not exist POSCAR 我检查了每个子文件夹（00-07），每个里面都是有POSCAR，而且格式也和vasp5.2的一样，在INCAR里面我也设置了ICHAIN =0，IMAGES =6 不知道为什么咧？ 很是纠结，谢谢大家能给我些建议！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 仿真建模与计算 |
» 猜你喜欢
93BebMhtakh前后11位开头都是大写
已经有5人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有86人回复
-
感觉是下周放榜了
已经有11人回复
-
filecode=后面第一个是大写字母
已经有10人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有4人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有15人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有9人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- vasp并行测试时出错。
已经有7人回复
- vasp并行出错，急于求助！！！
已经有13人回复
- vasp用neb计算迁移势垒
已经有11人回复
- vasp 并行运算出错
已经有7人回复
- vasp NEB 如何选取原胞大小 ？
已经有10人回复
- 【求助完结】Linux系统下MS5.5的并行计算调度问题
已经有12人回复
- 【求助】vasp计算过渡态结果出错
已经有17人回复
- 【求助】关于vasp NEB
已经有8人回复
- 【求助】vasp用neb计算过渡态报错，错误提示是什么意思？
已经有9人回复
- 【其他】vasp neb 计算讨论
已经有20人回复
- 【求助】vasp的NEB计算,输出需要哪些参数?
已经有7人回复
5楼2012-01-19 01:04:40
likai0106
金虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 2
- 应助: 38 (小学生)
- 金币: 1352.4
- 帖子: 233
- 在线: 68.5小时
- 虫号: 634278
- 注册: 2008-10-23
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2012-01-18 07:35:07
 |
3楼2012-01-18 11:12:11
4楼2012-01-19 00:55:19
yuraining
木虫 (小有名气)
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 2187.2
- 帖子: 56
- 在线: 259.3小时
- 虫号: 1503708
- 注册: 2011-11-22
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
【答案】应助回帖
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-29 22:43:05
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-29 22:43:05
|
你的makefile文件编译的就是串行的，如果你要编译并行的，把并行的那些选项打开： 201到203行：把注释去掉 CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \ -Dkind8 -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \ -DMPI_BLOCK=8000 228行：把注释去掉 FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dfurth.o fft3dlib.o |
6楼2013-07-27 22:17:24
