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vasp并行问题及NEB计算出错
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大家好!最近使用vasp遇到了奇怪的问题: (1)我的vasp是用mpif90编译的,然后递交任务的脚本也使用的是并行计算,脚本如下: #!/bin/bash #PBS -q normal #PBS -l nodes=32 #PBS -N siNF #PBS -l walltime=50:00:00 #PBS -o $PBS_JOBID.output module load intel-mvapich2-1.5 ulimit -s unlimited cd $PBS_O_WORKDIR mpiexec -n 32 vasp 任务是正常运行的,我用qstat看了,也是在32个节点上跑,可是最后的OUTCAR里面却显示的是串行版本,如下: vasp.5.2.2 15Apr09 complex executed on LinuxIFC date 2012.01.17 12:01:20 serial version (2)我把NEB编译到vasp里面后,运行出现如下错误: ERROR: the following files does not exist POSCAR 我检查了每个子文件夹(00-07),每个里面都是有POSCAR,而且格式也和vasp5.2的一样,在INCAR里面我也设置了ICHAIN =0,IMAGES =6 不知道为什么咧? 很是纠结,谢谢大家能给我些建议! |
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likai0106
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2楼2012-01-18 07:35:07
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3楼2012-01-18 11:12:11
4楼2012-01-19 00:55:19
5楼2012-01-19 01:04:40
yuraining
木虫 (小有名气)
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【答案】应助回帖
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流,, 2013-07-29 22:43:05
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流,, 2013-07-29 22:43:05
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你的makefile文件编译的就是串行的,如果你要编译并行的,把并行的那些选项打开: 201到203行:把注释去掉 CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \ -Dkind8 -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \ -DMPI_BLOCK=8000 228行:把注释去掉 FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dfurth.o fft3dlib.o |
6楼2013-07-27 22:17:24













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