24小时热门版块排行榜    

查看: 3117  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fuel

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】vasp用neb计算过渡态报错,错误提示是什么意思?

在vasp中neb方法计算过渡态,用Vasp TST Tools。使用了8个image。计算了一天半之后报错如下,请帮忙看是什么原因,怎么改进。

forrtl: Socket operation on non-socket
forrtl: severe (38): error during write, unit 8, file /home/00to09/05/OUTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp-neb           000000000073F8FD  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           000000000073E405  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           000000000068334F  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          000000343441D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           0000000000438299  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (28): CLOSE error, unit 20, file "Unknown"
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp-neb           0000000000682B82  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           00000000006C896B  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           0000000000CE9C07  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          000000343441D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp-neb           0000000000438299  Unknown               Unknown  Unknown
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 4 with PID 14985 on
node node25 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnuzhoulin

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-10-25 20:51:14
forrtl: severe (38): error during write, unit 8, file /home/00to09/05/OUTCAR
如果这个提示是原因,是不是磁盘满了?或者quota到了限定值?

因为毕竟已经开始计算了那么久,或者如果是集群,也有能是网络问题
4楼2011-10-25 19:12:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnuzhoulin

金虫 (小有名气)


uuv2010(金币+1): 欢迎参加交流 2011-10-25 20:51:22
引用回帖:
3楼: Originally posted by lsh1986914 at 2011-10-25 10:51:09:
我现在也在搞这个,也出现一大堆问题。我出现的问题也是莫名奇妙
[node14:19293] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19295] *** An error occurred in MPI_Cart_create
[node14:19295] *** on ...

你是运行过程中吗??
那应该就是编译所用MPI和运行时的不一致。
5楼2011-10-25 19:13:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fuel 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见