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hgt832

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】细菌基因组DNA的提取法(CTAB/NaCl 法),提取的DNA是否为细菌总DNA? 非� 已有10人参与

您好:

我需要提取革兰氏阳性菌的总DNA(包括染色体DNA和质粒DNA)。我在网上查到细菌基因组DNA的提取法(CTAB/NaCl 法),请问这种方法提的是总DNA的吗?(包括染色体DNA和质粒DNA) (下面附有这种方法步骤)

细菌基因组DNA包括染色体DNA和质粒DNA吗?还是细菌基因组DNA只指染色体DNA?

我用这种方法提了DNA,用染色体DNA上的引物进行PCR,灵敏度很高,而用质粒DNA上的引物进行PCR,灵敏度却很低。开始我怀疑是引物的问题,用碱法专门提取了质粒的DNA,用质粒DNA上的引物进行PCR,灵敏度变得很高。说明不是引物的问题,而是细菌基因组DNA的提取法(CTAB/NaCl 法)的问题,这种方法提的质粒DNA浓度太低。我困惑的是网上有说这种方法是可以提细菌总DNA的(包括染色体DNA和质粒DNA),但是我做的结果是这种方法提的质粒DNA浓度太低,根本满足不了实验要求。这种方法到底提的是总DNA的吗?还是提的是染色体DNA?

附 :细菌基因组DNA的提取法(CTAB/NaCl 法)

1. 将菌株接种于液体LB培养基,37℃震荡培养过夜。
2. 取1.5ml培养物12000rpm离心2min。
3. 沉淀物加入567 ul的TE缓冲液,反复吹打使之重新悬浮,加入30ul 10%SDS和15ul的蛋白酶K,混匀,于37℃温育1h.
4. 加入100ul 5mol/L NaCl, 充分混匀,再加入80ul CTAB/NaCl溶液,混匀后再65℃温育10min。
5. 加入等体积的酚/氯仿/异戊醇混匀,离心4-5min, 将上清转入一只新管中,加入0.6-0.8倍体积的异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,沉淀可稍加离心。
6. 沉淀用1ml的70%乙醇洗涤后,离心弃乙醇.

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hgt832

铜虫 (初入文坛)

我目的是提总DNA(包括染色体DNA和质粒DNA),我准备做多重PCR,有的目标DNA在染色体上,有的在质粒上,因此必须提总DNA。有什么好的提总DNA的方法(提的质粒DNA浓度高些)吗?非常感谢!
5楼2010-07-14 22:14:33
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查看全部 12 个回答

skyqiuqiu119

木虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我感觉不是总DNA,有待考证。
哎哟~可爱QQ~不错哦~~
2楼2010-07-14 12:12:09
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j2

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+1):正解~~~ 2010-07-14 23:18:15
革兰氏阳性菌该用溶菌酶作用1小时再按常规方法提吧
修炼ing,当虫仙……
3楼2010-07-14 16:48:11
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hgt832

铜虫 (初入文坛)

是的,我在第一步加了溶菌酶了。我目的是提总DNA(包括染色体DNA和质粒DNA),请问这种方法是提总DNA的吗?为什么这种方法提取的质粒DNA浓度很低。有什么好的提总DNA的方法(提的质粒DNA浓度高些)吗?非常感谢!
4楼2010-07-14 22:06:21
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