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【求助】DS里药效团验证分析 已有3人参与
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用DS创建药效团，结果如下： Hypothesis 1 ：HBA HBD RING AROMATIC totalcost=120.272 RMS=1.25965 correl=0.924155 Hypothesis 2 ：HBA HBD HYDROPHOBIC totalcost=120.5 RMS=1.17966 correl=0.940443 Hypothesis 3 ：HBA HBD RING AROMATIC totalcost=121.523 RMS=1.24763 correl=0.929403 Hypothesis 4 ： HBA HBD HYDROPHOBIC totalcost=123.094 RMS=1.40651 correl=0.898541 Hypothesis 5 ：HBA HBD HYDROPHOBIC RING AROMATIC totalcost=130.502 RMS=1.68364 correl=0.84254 Hypothesis 6 ：HBA HBD HYDROPHOBIC RING AROMATIC totalcost=131.416 RMS=1.8292 correl=0.802104 Hypothesis 7 ：HBA HBD RING AROMATIC totalcost=132.056 RMS=1.6421 correl=0.858203 Hypothesis 8 ： HBA HBD RING AROMATIC totalcost=132.355 RMS=1.70603 correl=0.839933 Hypothesis 9 ：HBA HBD HYDROPHOBIC RING AROMATIC totalcost=133.348 RMS=1.80648 correl=0.811487 Hypothesis 10 ：HBA HBD HYDROPHOBIC RING AROMATIC totalcost=136.139 RMS=1.92431 correl=0.778733 NULL Hypothesis ：totalcost=184.73 RMS=3.05552 correl=0 Fixed Cost: totalcost=91.5697 RMS=0 correl=0 Config=13.0818 其中Hypo 1的cost 与NULL cost差值>60,correl>0.9，config<17,那么这个模型可以称为合理吗？用Hypo 1对测试集预测活性，其中相关系数为r=0.76,那么这个预测是系数值可以吗？再问一下，在DS里怎么做Fischer’s randomization验证呢？看到一篇文献有做Fischer’s randomization验证，但是具体该怎么操作呢？ 谢谢各位大虾，不甚感激！！ |
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3楼2010-07-06 19:35:40
2楼2010-07-06 16:29:13
4楼2010-07-06 20:49:32
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我刚刚试了一下，只是把置信区间设为95%，然后其它的跟以前一样，再运行3D QSAR Pharmacophore，在report里有cost.csv打开是表格，里面是cost值，那么意思就是说spread sheets都默认就可以了？ 然后下面会有 Confidence Level - 95% Significance for hypothesis 1 is 90% Significance for hypothesis 2 is 90% Significance for hypothesis 3 is 90% 这个Significance for hypothesis 1 is 90%表示的是什么意思呢？ 谢谢！ |
5楼2010-07-06 22:06:31