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【讨论】同一蛋白质分成不同部分建模得到的结构如何生成一个结构? 已有8人参与
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我对一个跨膜蛋白质psi-blast后（1-442AA），发现序列同源性不高，仅66-413AA有序列相似性很高的pdb结构用来建模，也就是说前面有接近65AA无法用同源建模方法来建模，我的思路是前面65AA采用线索(threading)法产生模型，66-413AA采用同源建模方法产生模型。现在的问题是怎么将得到的两个子模型合成一个完整的模型呢（1-442AA）？对这种蛋白质建模，大家有什么好的办法么？提示个思路 这种情形很常见，请大家畅所欲言 |
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chongchong11
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-31 16:03:55
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-31 16:03:55
| threading的软件很多，对于蛋白质的建模的软件，推荐一个网站，几乎收录了所有建模软件和在线服务器，http://expasy.org/tools/ |
3楼2010-05-31 09:53:12
britney137803
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