24小时热门版块排行榜    

查看: 2105  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhangdagou5858

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】同一蛋白质分成不同部分建模得到的结构如何生成一个结构? 已有8人参与

我对一个跨膜蛋白质psi-blast后(1-442AA),发现序列同源性不高,仅66-413AA有序列相似性很高的pdb结构用来建模,也就是说前面有接近65AA无法用同源建模方法来建模,我的思路是前面65AA采用线索(threading)法产生模型,66-413AA采用同源建模方法产生模型。现在的问题是怎么将得到的两个子模型合成一个完整的模型呢(1-442AA)?对这种蛋白质建模,大家有什么好的办法么?提示个思路


这种情形很常见,请大家畅所欲言
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chongchong11

至尊木虫 (著名写手)

Senior Engineer


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
新手,看看,这方面好像有点深!!!
Nature+Science=Wisdom
4楼2010-05-31 22:35:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhangdagou5858 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见