24小时热门版块排行榜    

查看: 2564  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhangdagou5858

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】同一蛋白质分成不同部分建模得到的结构如何生成一个结构? 已有8人参与

我对一个跨膜蛋白质psi-blast后(1-442AA),发现序列同源性不高,仅66-413AA有序列相似性很高的pdb结构用来建模,也就是说前面有接近65AA无法用同源建模方法来建模,我的思路是前面65AA采用线索(threading)法产生模型,66-413AA采用同源建模方法产生模型。现在的问题是怎么将得到的两个子模型合成一个完整的模型呢(1-442AA)?对这种蛋白质建模,大家有什么好的办法么?提示个思路


这种情形很常见,请大家畅所欲言
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

精华帖转载

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangdagou5858

银虫 (小有名气)

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-31 16:03:55
threading的软件很多,对于蛋白质的建模的软件,推荐一个网站,几乎收录了所有建模软件和在线服务器,http://expasy.org/tools/
3楼2010-05-31 09:53:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

qixingbao07

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-31 09:23:29
前面65AA采用线索(threading)法产生模型,
能不能讲讲具体是用什么软件做的,方法是什么。谢谢
2楼2010-05-31 06:00:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chongchong11

至尊木虫 (著名写手)

Senior Engineer


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
新手,看看,这方面好像有点深!!!
Nature+Science=Wisdom
4楼2010-05-31 22:35:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

britney137803

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
请问你是怎么看的序列同源性?
5楼2010-06-03 14:27:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +4 炎黄贵胄 2026-08-22 5/250 2026-08-24 02:09 by 流流伤
[基金申请] 让我中一个面上吧! +12 大萍1987 2026-08-20 15/750 2026-08-23 20:44 by 大萍1987
[基金申请] 什么时候开奖? +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见