24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1769  |  回复: 9

xiaoru2010

[交流] 【求助/交流】测序结果分析问题 已有8人参与

测出来的序列里没有我的引物,是不是肯定没连接上?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoguang711

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1): 2010-04-19 11:13
反向互补一下再找找
要么就是扩到其它基因上
或者是测序的克隆是假阳性的
2楼2010-04-19 10:53:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓远洪dyh

新虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1): 2010-04-19 11:13
如果是自己做的测序,很有可能是测序的体系有问题,PCR产物处理不好
在外面测得话有可能是你自己的菌是假阳性
3楼2010-04-19 11:08:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风中摇曳

木虫 (正式写手)

热爱科学

克隆后应该需要鉴定再测序。
scienceisnature
4楼2010-04-19 11:10:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+3):谢谢交流! 2010-04-22 11:19
首先判断测序信号是否异常,比如出现连续重复序列、峰过低、重叠峰等,都属异常
然后做Blast比对,比对结果如果是整段序列都是载体序列,那说明测的是假阳性
如果以上两点都排除了,还是找不到引物序列,那么说明连接的片段不是目的片段,此处要注意,找引物,不是直接查找,而是需要比对,因为有可能会有一些碱基没有正常配对
5楼2010-04-19 11:49:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gene001

金虫 (正式写手)

就是个普通教师


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
要知道你的引物本身就很多种序列!也许你没把所有兼并可能性都检查????
大家共同交流、共同提高!!!
6楼2010-04-19 16:38:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoru2010

我做了BLAST,是空载,谢谢!
7楼2010-04-22 08:54:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaiyf

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我们实验室的测序结果也有同样的现象,我们一般都是让测序公司再测一遍。一般不会是样品的问题,应当是测序的问题。
多看文献,多学知识
8楼2010-04-22 16:41:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
9楼2010-04-22 19:25:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xiaoru2010 at 2010-04-22 08:54:46:
我做了BLAST,是空载,谢谢!

空载就是肯定没连上,你检测是阳性之后再测序啊,用酶切检测相对可靠,PCR也凑合,但是不检测就送去,这不是白浪费钱嘛
10楼2010-04-22 22:21:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiaoru2010 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 279求调剂 +9 张番茄不炒蛋 2026-04-11 9/450 2026-04-12 22:22 by paopaotu326
[考研] 316求调剂 +5 想读研究生( ?∵ 2026-04-07 5/250 2026-04-12 00:43 by 蓝云思雨
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +20 yzyzx 2026-04-09 21/1050 2026-04-12 00:12 by 小小小小啦啦啦
[考研] 266求调剂,一志愿哈工程电子信息,本科获多项国奖和省奖 +8 lumine1 2026-04-06 8/400 2026-04-11 18:35 by 逆水乘风
[考研] 广东省 085601 329分求调剂 +14 Eddieddd 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:58 by bljnqdcc
[考研] 368求调剂 +3 17385968172 2026-04-10 3/150 2026-04-10 20:12 by 电子奥德彪
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[考研] 071000生物学调剂求助 +17 zzzzwww 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 15:55 by 求调剂zz
[考研] 材料复试求调剂 +20 xhhdjdjsjks 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 10:25 by 孙小小12457
[考研] 考研二轮调剂 +8 故人?? 2026-04-09 8/400 2026-04-10 09:44 by 青梅duoduo
[考研] 求调剂材料科学与工程一志愿985初试365分 +5 材化李可 2026-04-08 5/250 2026-04-09 17:00 by Lilly_Li
[论文投稿] 求助文献原文 10+3 18500821399 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:56 by 北京莱茵润色
[考研] 085501机械英二77总分294求调剂,接受跨专业学习 +6 守法公民亓纪 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:55 by wp06
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +11 emokidd 2026-04-08 12/600 2026-04-09 09:24 by wyf236
[考研] 材料考研求调剂总分280 +30 mkjlz1 2026-04-06 35/1750 2026-04-08 21:25 by cyh—315
[考研] 287求调剂 +6 Fnhc 2026-04-07 6/300 2026-04-08 10:05 by xingguangj
[考研] 一志愿西南090202求调剂 +4 在线求有学上 2026-04-07 4/200 2026-04-07 19:47 by biomichael
[考研] 325 调剂 +6 QQ小虾 2026-04-07 6/300 2026-04-07 15:17 by Ccclqqq
[考研] 333求调剂 +6 合乘杨习夕 2026-04-06 6/300 2026-04-07 09:44 by 猪会飞
[考研] 307求调剂 +3 所念及所望 2026-04-06 3/150 2026-04-06 17:30 by 土木硕士招生
信息提示
请填处理意见