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xtcao668

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】酿酒酵母真核表达载体构建和连接的问题 已有4人参与

各位网友,目前在做酿酒酵母表达,我外源基因片段酶切位点在我用的真核表达载体pYX212上没有合适位点。但是,由于该表达载体上有限制性酶EcoR V 的酶切位点,我用EcoR V 酶切后72摄氏度加dTTP两个小时,经琼脂糖凝胶电泳或者酚氯仿沉淀后,按载体:外源基因=1-(3~7)加T4酶连接过夜后先转化感受态大肠杆菌,但是做过多次均是载体自连(经双酶切鉴定); 并且载体:外源基因=1:10 也做过,还将载体先在45度上保温后再加T4酶和buffer,结果也是载体自连。
    特来求助,用碱性磷酸酶去磷酸化处理去磷酸化是不是可以避免载体自连?去磷酸化后要凝胶回收吗(凝胶回收效率很低)?还有就是去磷酸化后连接时需要加入ATP吗?(一般是载体、外源基因、T4酶、T4 buffer) 希望做过的网友支持一下。

    抱歉,有点长,谢谢啦!
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tianpingpe

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢交流 12-14 12:35
xtcao668(金币+5,VIP+0):乐于助人 12-14 18:53
用碱性磷酸酶去磷酸化是可以避免载体自连,一般去磷酸化是乙醇沉淀回收。
如果没有合适的酶切位点,你可以通过pcr的手段添加合适的,或者是添加同尾酶也是可以的。
2楼2009-12-14 11:44:04
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)

★ ★ ★ ★
1949stone(金币+1,VIP+0): 12-14 12:35
xtcao668(金币+3,VIP+0):乐于助人 12-14 18:53
可以考虑INFUSION技术
3楼2009-12-14 12:20:43
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308145157

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
使用LIC(Ligation Independent Cloning)技术吧,不需要考虑酶切位点的影响。挑重组子基本百分百正确。
心若在,梦就在......
4楼2010-07-05 15:13:34
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天外飞仙→顺

铜虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-07-05 15:27:57
载体自连有两个原因:  一是你的目的基因没有切开,可能是酶加的少
                      二是你的目的基因浓度太低了,可以用核算定量仪测试一下


祝实验顺利
我无法改变自己的出生,但我可以决定自己的命运:命中注定我是一个王者,我必须拿出王者的风范!!!
5楼2010-07-05 15:21:17
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
T载体不能去磷酸化吧,去了还能连上吗  怀疑!
觉得很可能是你根本没有加上T,或者是单酶切不充分。。。加dTTP后是不是应该加上taq,没见你提到。。。
下面是T载体制备方法,你比较一下看看吧。。。。
http://my.muchong.com/space.php?uid=860534&do=blog&id=130794
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
6楼2010-07-05 15:38:36
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jane晨宝儿

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有没有可能是你的连接用的目的基因浓度太低的原因?可以测试下,如果目的基因浓度特别低,而载体浓度又很高的话,载体自连就很容易发生的。去试试。
7楼2012-12-09 22:42:13
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