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韩恋希

铜虫 (初入文坛)

[求助] 重组质粒双酶切验证,载体条带可以看到,目的基因条带跑不出来 已有5人参与

转染感受态细胞挑菌纯培养之后试剂盒小提质粒,右边图是提的质粒直接跑的pcr,左边是酶切之后再跑的,载体pc DNA3.1(+),载体+目的基因应该大约六千,质粒五千,目的基因一千,
1.不知道为什么一直跑不出来一千的条带
2.挑一个菌落摇菌为什么质粒会有五千和六千两种?

重组质粒双酶切验证,载体条带可以看到,目的基因条带跑不出来


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shx0743

新虫 (正式写手)

一千的带子看不到也可能是因为亮度比,我们扫胶的时候可能由于大片段看起来很亮导致小片段看不清,你可以尝试加大上样量再跑一下试试!

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9楼2016-03-13 21:04:16
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普通回帖
2楼2016-03-12 22:31:32
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
右边图提质粒后直接去做pcr的?不懂什么意思,那pcr目的条带应该是多大呢,你右边的图条带特异性也不好,看不出来什么。左边直接酶切的,我怎么看着你左上图,好多质粒根本没有切开呢,不知道你酶切体系和时间。还有提取码质粒直接电泳,一般都是会有两到三天带的,你所谓的五千和六千条带,实际上只是同一个质粒的不同构型而已,比如同一个质粒环状超螺旋和线性开环的,在电泳时候跑的位置是不一样的,。所以质粒没有酶切直接进行电泳,只可以定性的看看质粒是否提取成功以及提取的浓度,对质粒的大小没有参考价值,那需要进行酶切,才可以的,祝好!

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
3楼2016-03-13 08:07:14
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Bioexperixgs

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-03-13 08:07:14
右边图提质粒后直接去做pcr的?不懂什么意思,那pcr目的条带应该是多大呢,你右边的图条带特异性也不好,看不出来什么。左边直接酶切的,我怎么看着你左上图,好多质粒根本没有切开呢,不知道你酶切体系和时间。还有 ...

好像试剂盒提取的质粒一般只有一种构型吧?

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4楼2016-03-13 12:50:03
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cch2012

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by Bioexperixgs at 2016-03-13 12:50:03
好像试剂盒提取的质粒一般只有一种构型吧?
...

质粒在提取的过程中,会由于机械损伤等原因,导致出现两到三条带,即CCC,OC,L三种构型,进行凝胶电泳的时候泳动速度不同,从而会看到两到三天带。提取质量比较好的话会有两条,一般是三条

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5楼2016-03-13 13:19:06
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by Bioexperixgs at 2016-03-13 12:50:03
好像试剂盒提取的质粒一般只有一种构型吧?
...

那看你的操作了,我们基本提出来都是三天带的。

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
6楼2016-03-13 14:52:32
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thinka

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
转化后,直接挑菌落做菌落PCR,阳性的克隆再去接种摇菌提质粒就好了,如果先接种提质粒,那也可以质粒做模板做个PCR看看有没有目的带。

如果总是找不到阳性克隆那可能是自连了,载体酶切的时候没有切好,构建载体要舍得花钱买好酶,钱是老板的,时间是你自己的
7楼2016-03-13 16:53:31
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Bioexperixgs

新虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by cch2012 at 2016-03-13 13:19:06
质粒在提取的过程中,会由于机械损伤等原因,导致出现两到三条带,即CCC,OC,L三种构型,进行凝胶电泳的时候泳动速度不同,从而会看到两到三天带。提取质量比较好的话会有两条,一般是三条
...

OMIGA质粒小抽试剂盒,一直是很亮的一条带

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8楼2016-03-13 18:10:32
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linxia_yuer

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先要确定自己的目的基因是否插入到载体上面去了,一般需要做个菌液pcr或者质粒pcr来验证。确定有的话,酶切的体系和时间按照要求来,一般能切到小片段。如果切了跑电泳还是看不到条带,楼上说的条带亮度比也是要注意下,不过看你的主带很亮,应该质粒是够的。检查末端是否同尾酶连接的,能连上但是原有酶切位点就不再识别了。pcr鉴定正常,没有酶切目的条带,建议直接送测序。不要耽搁时间。
10楼2016-03-14 10:16:17
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