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关于对PCR产物进行胶回收的问题
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dongxu451
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关于对PCR产物进行胶回收的问题
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最近在做质粒构建实验,需要对PCR产物进行胶回收,而且在酶切后还要再次进行胶回收。在测DNA浓度的时候,浓度还可以,但是吸收峰相比于正常情况要偏离很多,但是胶回收过程中的电泳条带很清晰,只是检测这一步发现吸收峰的偏差很大,怀疑这是导致我后续的连接实验失败的一个重要原因,有没有大神可以解决,我用的是康维世纪的琼脂糖DNA凝胶回收试剂盒。
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2016-03-07 09:25:41
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lifechuteng
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2016-03-07 10:21:59
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2016-03-07 20:12:08
跑电泳只能看出电泳条带,所以肯定是单一的。
造成吸收峰偏移的最主要原因是回收后样品有蛋白或者盐离子污染,跑电泳是看不出来的。
您可以优化一下回收步骤,尽量去除这些杂质。
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2016-03-07 09:28:44
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dongxu451
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专业: 微生物遗传育种学
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2楼
:
Originally posted by
lifechuteng
at 2016-03-07 09:28:44
跑电泳只能看出电泳条带,所以肯定是单一的。
造成吸收峰偏移的最主要原因是回收后样品有蛋白或者盐离子污染,跑电泳是看不出来的。
您可以优化一下回收步骤,尽量去除这些杂质。
我感觉问题也是出现在回收步骤中,但是我是按照试剂盒的说明书的步骤做的,而且试剂盒中的推荐步骤我也根据自己的序列情况加以改进,实在想不出其他可以改进的地方了。步骤中说加3倍体积溶胶液,我是不是可以再多加一些?有一步除去乙醇,我一般是开盖晾10min,这步骤有必要再延长时间么?
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2016-03-07 10:17:51
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dongxu451
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sunlk
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2016-03-07 20:10:59
胶回收肯定会出现这种情况,多多少少肯定会有偏离,但是不影响偏离结果。另外如果浓度大的话,有点污染无所谓
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很给力
5楼
2016-03-07 14:37:31
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dongxu451
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5楼
:
Originally posted by
sunlk
at 2016-03-07 14:37:31
胶回收肯定会出现这种情况,多多少少肯定会有偏离,但是不影响偏离结果。另外如果浓度大的话,有点污染无所谓
浓度的话,载体大片段浓度只有15左右,目标片段浓度大约40多,这样做连接效率高不?
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6楼
2016-03-07 14:53:02
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dongxu451
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7楼
2016-03-07 18:27:18
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可以用DNA纯化试剂盒纯化下,但是会有损耗。
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8楼
2016-03-07 20:52:54
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