| 查看: 1215 | 回复: 3 | ||
小小佐罗2木虫 (正式写手)
|
[求助]
菌株16s鉴定（系统发育树）
|
大家好：最近在做细菌的16s的鉴定工作，遇到很多问题，想向大家请教一下，首先我用了16s通用引物进行测序，测序结果在NCBI上进行BLAST比对，结果发现和很多菌的同源性都在99%，最后查了一些资料通过系统发育树来鉴定，于是下载了同源性>98%的标准菌株16s序列利用mega5建立系统发育树，结果没有和一种菌在同一枝上面，附图，第一次做也不知道问题出在哪里，只是想通过系统发育树找到最近的那个菌株初步确定菌株种属。还望大神指点！谢谢！ E@}}]`6UHLVMMUQG4J5SL5B.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
细菌属种鉴定问题
已经有21人回复
- 如何通过16SrDNA鉴定菌种
已经有16人回复
- 如何上传菌株的序列号
已经有8人回复
- 微生物生理生化鉴定准确性
已经有11人回复
- 揪心的菌落PCR
已经有16人回复
- 16S rRNA序列测定后如何查询菌的种属
已经有12人回复
- 16S rDNA测序问题
已经有21人回复
- 我去做菌种鉴定16S RNA 测出来5条 片段……请问这是怎么回事？
已经有4人回复
- 鉴定细菌种（不是属）的生物学方法有哪些
已经有27人回复
- 如何鉴定一个新分离纯化获得的菌株的分类地位？
已经有13人回复
- 请教5.8s 16s 18s 26s 28s分别指什么？
已经有9人回复
- 16s rDN鉴定菌株，没有相似性
已经有15人回复
- 菌株16S rDNA同源性分析方法！！
已经有5人回复
- 做16S rDNA鉴定时进行同源性比较的方法！！
已经有18人回复
- 求菌株安全性的鉴定详细方法
已经有3人回复
- 标准菌株购买
已经有11人回复
- 16S rRNA 和16S rDNA的区别
已经有10人回复
- 16S rDNA测序问题
已经有3人回复
- 16s rDNA 扩增引物的选择
已经有9人回复
- 【原创】16S rRNA鉴定
已经有10人回复
小小佐罗2
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3357.2
- 散金: 1
- 红花: 2
- 帖子: 396
- 在线: 299.9小时
- 虫号: 1358081
- 注册: 2011-08-01
- 性别: GG
- 专业: 畜牧学
2楼2013-08-13 09:04:41
hkqgeoffrey
金虫 (小有名气)
- 应助: 58 (初中生)
- 金币: 1351.4
- 散金: 3
- 红花: 2
- 帖子: 135
- 在线: 45.4小时
- 虫号: 2546967
- 注册: 2013-07-15
- 性别: GG
- 专业: 病毒学
3楼2013-08-13 15:42:10
lilongping
新虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 5960.1
- 散金: 20
- 帖子: 613
- 在线: 64.6小时
- 虫号: 884477
- 注册: 2009-10-26
- 性别: GG
- 专业: 畜牧学
哈哈哈 4楼2013-08-15 11:06:42
