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LeonardoChen

金虫 (小有名气)

[求助] 重组质粒转化后提的平板有很多菌落,但是菌落PCR 没有结果。 已有3人参与

重组质粒PET28a,转化到大肠杆菌(BL21),涂布到平板,37℃,培养14h左右,单菌落数有很多然后随机挑取10单菌落,加入50微升无菌水,煮沸40min,做菌落PCR,第一次pcr体系是:10微升buffer ,1微升Taq ,1微升dNTP MIX ,1微升T7引物 ,1微升T7Terminator  ,86微升无菌水。分装每管9微升,再加入1微升煮沸的菌液,进行PCR,跑胶结果显示有阳性克隆,但是测序结果显示都是假阳性。
第二次尝试用另一种方法:10微升buffer ,1微升Taq ,1微升dNTP MIX ,1微升T7Terminator  ,1微升引物R(就是自己刚开始做克隆设计的引物) ,86微升无菌水。分装每管9微升,再加入1微升煮沸的菌液,进行PCR,跑胶结果显示都没有阳性克隆。
PCR反应条件:95℃ 5min,Sample Text   72℃ 10min,4.0℃ pause

各位能不能帮我分析下,为什么单菌落那么多却没有阳性克隆,如果是实验操作的原因最可能会出现在哪一步?谢谢,不甚感激!
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MMCCBB

新虫 (著名写手)


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-10-12 13:40:24
你先测序看重组质粒是否正确,有可能是载体自连

发自小木虫Android客户端
2楼2015-09-27 22:59:35
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飞龙在天605

禁虫 (初入文坛)


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-10-12 13:40:31
本帖内容被屏蔽

3楼2015-10-12 13:19:54
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赵鑫易

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

lz你就不能用Taq mix吗省时省力
菌落PCR不用煮沸,pcr的时候94°多变性5min基本就好了

回答:重组质粒是什么,是刚连接上的还是提的。
一般是构建表达载体(t4连接之类),连接产物转化到DH5a或top10,然后挑克隆菌落培养同时pcr检测,提质粒酶切检测,都没问题再去测序,测序没问题再转到BL21
4楼2015-10-12 14:01:02
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高gaoeryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

从你的描述来看,第一次用载体上引物进行菌落PCR验证,出现阳性克隆,但测序不对;第二次用载体和片段的引物,未出现阳性克隆。
一般来讲,质粒转BL21成功率很高,你得到了较多的转化子,转化应该是没有问题的。
可以绕过菌落PCR验证,选择4~10个转化子进行酶切验证,因为菌落PCR假阳性较高
一定要菌落PCR的话用你的第二次方法,多挑点转化子,一次做30个,嘿嘿

还有从你的描述上看你才做了一次转化,也可以再重复一次看看
再给你个经验,尽量挑取菌落小的克隆子,分散着挑别扎堆

这个都是模式化的操作,没问题的,再试试呗
5楼2015-10-12 17:24:09
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tolobio

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

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仅供参考!
6楼2015-10-15 12:31:01
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