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真菌鉴定问题 已有2人参与
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| 本人以前没有做过真菌鉴定，属于菜鸟。最近分到一株真菌，PCR得到ITS序列，在NCBI上比对同源性为91-92%，请问是新种可能性大吗？下一步应该做什么实验确定是不是新种或新属呢？谢谢各位前辈！ |
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haloarchaeon
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2楼2015-07-09 14:53:20
3楼2015-07-09 17:23:50
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shmilying
铁杆木虫 (著名写手)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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重新测序，双峰不能用； 重测得时候：1、获菌株ITS序列，比对，若相似性小于97%，就可以考虑是否新种，进一步要做如下基因座的标记基因： Sequence markers nucLSU---large subunit of the nuclear ribosomal RNA operon RPB2---partial second largest subunit of the RNA polymerase II BT2---partial β -tubulin ITS---entire rDNA internal transcribed spacer region (ITS) 扩增获得菌株四个基因座的序列，单独对每一个标记基因构树，看目标菌株的发育关系，互相印证； 如果是新种，那就可以搞后续工作，你娃一篇SCI又华丽出炉了 下一个节目就是：感谢我！哈哈 |
5楼2015-07-10 09:09:30