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woaipengpeng

新虫 (小有名气)

[求助] NEB计算结果如何分析 已有2人参与

过渡态正计算中neb.dat结果如图,结构拉出来发现原子位置已经乱了,该怎么办呢?

NEB计算结果如何分析
图片1.png
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by woaipengpeng at 2015-07-06 12:02:55
我现在刚开始用NEB计算,只会用nebmake.pl产生路径,求问大神还有什么其他的方法吗?...

你应该先看看你反应物和产物的构型是不是有问题,中间的点可以在nebmake.pl完后,自己手动修改一下坐标,还有步长设置过大也有可能造成这种情况。还有我不是大神,我才搞这个半年多而已。
4楼2015-07-06 14:04:42
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流。 2015-07-06 19:33:53
如果路径完全乱掉,不是你基态有问题,就是路径没找对。
2楼2015-07-06 11:28:07
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woaipengpeng

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xxxxxxxfc at 2015-07-06 11:28:07
如果路径完全乱掉,不是你基态有问题,就是路径没找对。

我现在刚开始用NEB计算,只会用nebmake.pl产生路径,求问大神还有什么其他的方法吗?
3楼2015-07-06 12:02:55
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流。 2015-07-06 19:34:01
引用回帖:
3楼: Originally posted by woaipengpeng at 2015-07-06 12:02:55
我现在刚开始用NEB计算,只会用nebmake.pl产生路径,求问大神还有什么其他的方法吗?...

MS也可以用来插点的
5楼2015-07-06 15:39:51
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