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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » mega系统发育树构建
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骆驼人

金虫 (正式写手)

[交流] mega系统发育树构建

各位师兄师姐们，小妹有一个疑问，mega构建系统发育树的时候是以核酸序列为基础，还是以氨基酸序列为基础呢？两者如何选择，在哪些情况下选择核酸序列，在哪些情况下选择氨基酸序列呢？
我现在遇到的情况是，具有一个基因家族的基因序列和氨基酸序列，任务是对该基因家族进行VIGS沉默。那么我选用基因序列来构建系统发育树，应该是较氨基酸序列合适的吧？可是老师说了，为什么不选用氨基酸序列来构建树？我就郁闷了。。。。
求解疑！
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愿你，温柔又坚定，不轻易许诺但许的诺一定会实现，有勇气有力量，会发现一切美好的事物
1楼 2015-06-26 18:25:23
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阿Q~~

至尊木虫 (文坛精英)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
路过的看了一下，帮顶，祝福你好运！~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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自强不息，厚德载物；独立精神，自由思想。
2楼2015-06-26 19:06:39
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jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
用核酸序列构建进化树也要把核酸序列翻译成氨基酸序列。
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3楼2015-06-26 21:28:05
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arfield88

铜虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-06-29 09:36:03
个人认为看你比较的进化树的进化关系了 如果这个进化关系很近 需要分的很细 那就用核苷酸序列 如果这个进化关系很远 用氨基酸呗 核苷酸翻译成氨基酸的时候 会损失掉一些信息 如第三位密码子突变 不会引起氨基酸序列的变化。水平有限 只能帮到这了
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4楼2015-06-28 10:02:08
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andywang6137

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
好像还没听说用基因序列构建系统发育树的。只有蛋白质是保守的
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5楼2015-06-29 10:29:16
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