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骆驼人

金虫 (正式写手)

[交流] mega系统发育树构建

各位师兄师姐们,小妹有一个疑问,mega构建系统发育树的时候是以核酸序列为基础,还是以氨基酸序列为基础呢?两者如何选择,在哪些情况下选择核酸序列,在哪些情况下选择氨基酸序列呢?
我现在遇到的情况是,具有一个基因家族的基因序列和氨基酸序列,任务是对该基因家族进行VIGS沉默。那么我选用基因序列来构建系统发育树,应该是较氨基酸序列合适的吧?可是老师说了,为什么不选用氨基酸序列来构建树?我就郁闷了。。。。
求解疑!
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愿你,温柔又坚定,不轻易许诺但许的诺一定会实现,有勇气有力量,会发现一切美好的事物
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阿Q~~

至尊木虫 (文坛精英)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
路过的看了一下,帮顶,祝福你好运!~~~~~~~~~~~~~~~~~~
自强不息,厚德载物;独立精神,自由思想。
2楼2015-06-26 19:06:39
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jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用核酸序列构建进化树也要把核酸序列翻译成氨基酸序列。
123456
3楼2015-06-26 21:28:05
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arfield88

铜虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-06-29 09:36:03
个人认为看你比较的进化树的进化关系了 如果这个进化关系很近 需要分的很细 那就用核苷酸序列 如果这个进化关系很远 用氨基酸呗 核苷酸翻译成氨基酸的时候 会损失掉一些信息 如第三位密码子突变 不会引起氨基酸序列的变化。水平有限 只能帮到这了
4楼2015-06-28 10:02:08
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andywang6137

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
好像还没听说用基因序列构建系统发育树的。只有蛋白质是保守的
5楼2015-06-29 10:29:16
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