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如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键 已有2人参与
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如题 如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键 大家好，最近我在用gaussian软件计算分子间的相互作用，但是对于操作步骤现在还是不太确定是不是正确的，所以向各位大牛详细请教一下。 现在我把我的计算步骤详细说一下 1）比如两个分子，分别称为分子A和分子B，两个分子之间会形成氢键作用 2）我用gaussian软件用B3LYP/6-311+G*基组分别计算了只有分子A存在的能量E(A)、只有分子B存在的能量E(B)以及同时存在两个分子（即分子A和分子B）的能量E(AB) 3）最后计算 认为E(AB)-E(A)-E(B)的绝对值是分子间的弱相互作用， 这样的计算方法对不对，还是说要加上BSSE修正E(BSSE)就行了 即|E(AB)-E(A)-E(B)|+E(BSSE) 请大家不吝赐教，在此谢谢大家了 |
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kong890109
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gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2015-06-24 17:09:32
| 需要BSSE校正，具体的弱相互作用分析方法可以参看此贴http://muchong.com/html/201408/7827455.html；使用过这里面的RDG方法，感觉挺形象的，你可以试试。 |
2楼2015-06-22 20:06:50
4楼2015-06-23 10:36:26
zhou2009
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B3LYP算氢键并不那么合用（参见“乱谈DFT-D”：http://sobereva.com/83），如果起点不高，计算结果很难说。 不知分子体系有多大。最起码要用b97d。最好用DFT-D。如果氢键体系较小，可以用mp4(sdtq)或者CCSD。 |
3楼2015-06-23 10:23:29
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