| 查看: 4459 | 回复: 13 | ||||
[求助]
如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键 已有2人参与
|
||||
|
如题 如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键 大家好，最近我在用gaussian软件计算分子间的相互作用，但是对于操作步骤现在还是不太确定是不是正确的，所以向各位大牛详细请教一下。 现在我把我的计算步骤详细说一下 1）比如两个分子，分别称为分子A和分子B，两个分子之间会形成氢键作用 2）我用gaussian软件用B3LYP/6-311+G*基组分别计算了只有分子A存在的能量E(A)、只有分子B存在的能量E(B)以及同时存在两个分子（即分子A和分子B）的能量E(AB) 3）最后计算 认为E(AB)-E(A)-E(B)的绝对值是分子间的弱相互作用， 这样的计算方法对不对，还是说要加上BSSE修正E(BSSE)就行了 即|E(AB)-E(A)-E(B)|+E(BSSE) 请大家不吝赐教，在此谢谢大家了 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 gaussian资源 |
» 猜你喜欢
分子动力学模拟合作需求
已经有4人回复
-
中国科学院成都山地灾害与环境研究所2026年特别研究助理（博士后）招聘启事
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有131人回复
-
湖北文理学院材料与化工专硕还有调剂名额，欢迎大家推荐考生！
已经有1人回复
-
湖南大学刘巧玲课题组2026年博士研究生招生信息
已经有28人回复
-
南方科技大学表面催化反应动力学研究课题组招收2026届博士生
已经有1人回复
-
北京邮电大学物理学院老师招收博士生
已经有3人回复
-
Comsol 6.0 桶内肥料产热产湿过程模拟求助
已经有1人回复
-
微纳hub，微纳加工的宝库
已经有0人回复
-
微纳加工里的 lift-off 工艺
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 两个分子间的弱作用力
已经有3人回复
- Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
已经有10人回复
- gromacs氢键分析工具，g_hbond输出结果解析？
已经有11人回复
- 关于有机物之间的氢键问题
已经有9人回复
- HF分子间氢键比水分子间氢键强，但HF的沸点却比水的沸点低。原因是什么？
已经有4人回复
- M062x方法适合算氢键嘛~
已经有8人回复
- 蛋白之间相互作用的残基及作用力
已经有3人回复
- 用Gaussian求分子间作用力
已经有13人回复
- 高斯计算分子间相互作用
已经有11人回复
- 静电和氢键作用力！求大神指点
已经有7人回复
- 如何计算氢键键能
已经有7人回复
- 分子内氢键以何种形式存在如何做理论计算
已经有6人回复
- 如何抑制分子内氢键的产生？
已经有44人回复
- 氢键的作用与强弱区分
已经有6人回复
- 紧急求助，谁能帮我优化一个分子，关于氢键的
已经有12人回复
- 【求助】如何计算小分子或离子与一个二维结构材料之间的化学作用力如氢键、离子吸引？
已经有16人回复
- 【求助】请问如何利用MS计算水溶液中两种分子之间的作用力，分析分子间距离。
已经有11人回复
- 【求助】关于分子间氢键
已经有6人回复
- 【求助】PLATON软件的使用
已经有4人回复
- 【求助】用ms计算两个分子的相互作用势
已经有20人回复
- 【讨论】如何计算两分子间的有效相互作用力
已经有12人回复
kong890109
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 976.4
- 红花: 10
- 帖子: 139
- 在线: 133.6小时
- 虫号: 2382781
- 注册: 2013-03-28
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
★ ★
gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2015-06-24 17:09:32
gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2015-06-24 17:09:32
| 需要BSSE校正，具体的弱相互作用分析方法可以参看此贴http://muchong.com/html/201408/7827455.html；使用过这里面的RDG方法，感觉挺形象的，你可以试试。 |
2楼2015-06-22 20:06:50
4楼2015-06-23 10:36:26
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
十年磨练: 金币+5, ★有帮助 2015-11-03 09:32:15
感谢参与，应助指数 +1
十年磨练: 金币+5, ★有帮助 2015-11-03 09:32:15
|
B3LYP算氢键并不那么合用（参见“乱谈DFT-D”：http://sobereva.com/83），如果起点不高，计算结果很难说。 不知分子体系有多大。最起码要用b97d。最好用DFT-D。如果氢键体系较小，可以用mp4(sdtq)或者CCSD。 |
3楼2015-06-23 10:23:29
5楼2015-06-23 10:37:10
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
6楼2015-06-23 10:53:43
7楼2015-06-23 13:58:47
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
8楼2015-06-23 16:00:18
9楼2015-06-25 09:25:18
809011916
铜虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 316.4
- 帖子: 55
- 在线: 42.3小时
- 虫号: 1501800
- 注册: 2011-11-20
- 性别: GG
- 专业: 化工热力学和基础数据
10楼2015-07-24 01:45:06
30