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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 干扰/敲除 » 请问我要做基因敲除，上下游基因转录方向不同，如何设计引物
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571900696

金虫 (初入文坛)

[求助] 请问我要做基因敲除，上下游基因转录方向不同，如何设计引物

请问大神们，我最近要做原核生物中的一个基因敲除，但是我发现上下游基因转录方向不同，请问这个要如何设计引物？？听说设计敲除与基因位于正负链无关，但是我还是不太清楚具体的引物设计。。请大家帮忙一下，谢谢啦~~

请问我要做基因敲除，上下游基因转录方向不同，如何设计引物
敲除.JPG
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1楼 2015-06-09 17:34:43
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571900696

金虫 (初入文坛)
我需要将红的B基因敲除，箭头代表转录方向，因为之后要同源重组所以上下游同源臂要求800-1000bp，所以同源臂2包含两个不同转录方向的基因，我不清楚要如何设计。并且，设计好的引物P出来是不是应该同源臂2在上游，1在下游呢？？？
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2楼2015-06-09 17:38:14
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571900696

金虫 (初入文坛)
真的很着急！！！请不要沉！！！
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3楼2015-06-09 17:38:55
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)
基因敲除跟转录方向无关，只要不改变你下游的基因编码序列就不会影响正常按照序列设计引物

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2015-06-09 20:34:05
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571900696

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by guoqin_shiyin at 2015-06-09 20:34:05
基因敲除跟转录方向无关，只要不改变你下游的基因编码序列就不会影响正常按照序列设计引物

好的！！明白啦！！非常感谢！就是说我只要按照上下游的顺序，完整的基因编码序列就行对吧？？
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5楼2015-06-10 08:55:38
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