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Cindycclove

新虫 (小有名气)

[交流] 根据mRNA设计的引物 用gDNA做模板能否扩增出目的片段? 已有3人参与

如题,另外,如何在genebank上检测我的引物是否包含内含子呢?
谢谢大家帮我T-T
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xmcliulei

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
打开UCSC,在in silico PCR中输入你的上下游引物,直接submit,看看产物大小就知道有没有内含子了,顺便还能看看在基因组上的特异性怎么样~
2楼2015-06-01 23:55:05
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Cindycclove

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xmcliulei at 2015-06-01 23:55:05
打开UCSC,在in silico PCR中输入你的上下游引物,直接submit,看看产物大小就知道有没有内含子了,顺便还能看看在基因组上的特异性怎么样~

要选择基因组genome。这种鸡柔嫩艾美尔球虫 应该选什么啊
3楼2015-06-04 12:00:09
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piaoyidetian

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
是要构建载体吗?为什么不用cDNA做template呢?
4楼2015-06-04 14:03:16
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Cindycclove

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by piaoyidetian at 2015-06-04 14:03:16
是要构建载体吗?为什么不用cDNA做template呢?

因为我的RNA很容易降解啊~
5楼2015-06-05 14:54:54
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piaoyidetian

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by Cindycclove at 2015-06-05 14:54:54
因为我的RNA很容易降解啊~...

RNA都很容易降解的,在提取RNA过程中多注意细节还是能提到高质量的RNA的,可以尝试用OMEGA试剂盒提取,及时反转录
6楼2015-06-06 16:58:21
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Cindycclove

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by piaoyidetian at 2015-06-06 16:58:21
RNA都很容易降解的,在提取RNA过程中多注意细节还是能提到高质量的RNA的,可以尝试用OMEGA试剂盒提取,及时反转录...

是因为我的样品是保存在储存液里的虫卵,所以跟操作没有关系。它一直在降解。。。
7楼2015-06-07 12:40:47
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jinnini125

木虫 (小有名气)

8楼2017-05-09 15:01:29
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