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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 转录组得到的基因片段合成完整的cDNA
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于小歪

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 转录组得到的基因片段合成完整的cDNA 已有3人参与

亲，我做了个真核生物的转录组，转录公司给了一些转录组基因片段，我挑选了几个片段，请问怎样合成这几个片段分别所对应的完整的cDNA,谢谢。

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1楼 2015-06-01 15:54:43
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有参考基因组吗？如果有，拿去BLAST参考基因组。
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2楼2015-06-01 16:08:49
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a13515517892

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
感谢参与，应助指数 +1
去NCBI上blsat你的片段序列，看看和哪些是同源性较大的，在分析
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3楼2015-06-01 16:11:43
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于小歪

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by a13515517892 at 2015-06-01 16:11:43
去NCBI上blsat你的片段序列，看看和哪些是同源性较大的，在分析

这是拿贻贝做的转录组，我老板想叫我拿我们感兴趣的几个转录组片段合成他的完整dna

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4楼2015-06-01 22:49:15
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于小歪

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-06-01 16:08:49
有参考基因组吗？如果有，拿去BLAST参考基因组。

我们拿的是贻贝做的转录组，挑选了几个感兴趣的片段，现在想合成这个片段所对应的完整d na

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5楼2015-06-01 22:50:40
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great07225388

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 于小歪 at 2015-06-01 22:50:40
我们拿的是贻贝做的转录组，挑选了几个感兴趣的片段，现在想合成这个片段所对应的完整d na
...

你连转录组的序列信息都有了，剩下的就好办了。仍然提取RNA,逆转录成cDNA,用特异性的引物来扩增你的基因片段即可。引物根据你的序列信息来设计。

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6楼2015-06-10 21:21:31
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