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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » AUTODOCK中的聚类构型能说明什么问题？
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兔子8888

银虫 (初入文坛)

[求助] AUTODOCK中的聚类构型能说明什么问题？ 已有2人参与

不知道如何让分析Autodock中聚类构型能说明什么问题，该如何分析，请大神赐教！！！急！！！
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1楼 2015-05-21 00:44:42
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longdlut

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【答案】应助回帖

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簇类分析只是简单分析对接构象的稳定性，那些优势构象在对接中的占据比例，能量最低且所占比例最大的构象一般被认为是理想的
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2楼2015-05-21 20:40:56
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兔子8888

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2015-05-21 20:40:56
簇类分析只是简单分析对接构象的稳定性，那些优势构象在对接中的占据比例，能量最低且所占比例最大的构象一般被认为是理想的

能量最低？结合能不是越大越好么？求教

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3楼2015-05-21 22:48:27
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pymol

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【答案】应助回帖

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3楼: Originally posted by 兔子8888 at 2015-05-21 22:48:27
能量最低？结合能不是越大越好么？求教
...

能量越低越稳定，结合能越小越稳定！
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兔子8888
4楼2015-05-23 15:37:40
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兔子8888

银虫 (初入文坛)
送红花一朵
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4楼: Originally posted by pymol at 2015-05-23 15:37:40
能量越低越稳定，结合能越小越稳定！...

谢谢谢谢！！！不然出大丑了！！！

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5楼2015-05-23 21:58:23
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兔子8888

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pymol at 2015-05-23 15:37:40
能量越低越稳定，结合能越小越稳定！...

那结合能那个负号是什么意思，不好意思啊，本科论文，有点浅显，拜托指教！！！

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6楼2015-05-23 23:37:54
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pymol

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【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 兔子8888 at 2015-05-23 23:37:54
那结合能那个负号是什么意思，不好意思啊，本科论文，有点浅显，拜托指教！！！
...

结合能为负值才有意义的
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7楼2015-05-26 08:36:23
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