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晴晨夕语

新虫 (小有名气)

[求助] 相关酶基因表达差异 已有1人参与

我要做含硫氨基酸降解路径中关键酶的基因表达差异,现在有两种途径:1)转录组测序,进行功能注释,代谢通路,及GO、pathway等分析,挑选出差异表达的基因,再用荧光定量PCR验证通过功能注释,代谢通路分析得到的相关酶差异表达量。2)直接荧光定量PCR文献得知的关键酶(CBL)的差异表达量。请问哪种可行啊,做转录组分析是不是很鸡肋啊~
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪

★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2015-05-15 11:30:27
直接荧光定量PCR文献得知的关键酶(CBL)的差异表达量即可 不过你要求高,发文章可以考虑第一种
生命还需要奇迹来衬托
2楼2015-05-15 10:52:18
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晴晨夕语

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-05-15 10:52:18
直接荧光定量PCR文献得知的关键酶(CBL)的差异表达量即可 不过你要求高,发文章可以考虑第一种

如果只做第二种, 是不是不全面?会漏掉一些基因,说服力不强?文献和kegg查到的关键酶也不全面是吗?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2015-05-16 07:53:58
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

如果只用文献查找和数据库查找,说服力当然不强了。  建议做转录组分析,或者找贴合实验的一些公共测序or芯片数据做生信分析。
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
4楼2015-05-21 09:08:57
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