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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 相关酶基因表达差异
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晴晨夕语

新虫 (小有名气)

[求助] 相关酶基因表达差异 已有1人参与

我要做含硫氨基酸降解路径中关键酶的基因表达差异，现在有两种途径：1）转录组测序，进行功能注释，代谢通路，及GO、pathway等分析，挑选出差异表达的基因，再用荧光定量PCR验证通过功能注释，代谢通路分析得到的相关酶差异表达量。2）直接荧光定量PCR文献得知的关键酶（CBL）的差异表达量。请问哪种可行啊，做转录组分析是不是很鸡肋啊～
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1楼 2015-05-14 22:15:11
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪
★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2015-05-15 11:30:27
直接荧光定量PCR文献得知的关键酶（CBL）的差异表达量即可 不过你要求高，发文章可以考虑第一种
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生命还需要奇迹来衬托
2楼2015-05-15 10:52:18
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晴晨夕语

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-05-15 10:52:18
直接荧光定量PCR文献得知的关键酶（CBL）的差异表达量即可 不过你要求高，发文章可以考虑第一种

如果只做第二种， 是不是不全面？会漏掉一些基因，说服力不强？文献和kegg查到的关键酶也不全面是吗？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼2015-05-16 07:53:58
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

如果只用文献查找和数据库查找，说服力当然不强了。  建议做转录组分析，或者找贴合实验的一些公共测序or芯片数据做生信分析。
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
4楼2015-05-21 09:08:57
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