| 查看: 1251 | 回复: 7 | |||
[求助]
PEG修饰多肽进行动力学模拟，如何添加适于PEG模拟的GROMACS力场文件 已有2人参与
|
现在需要进行PEG修饰的十八肽的分子动力学模拟，文献中PEG修饰蛋白质的分子动力学模拟是通过GROMACS进行的，文中提到在GROMACS力场文件中添加了PEG的残基名及电荷等，但未说明具体是怎么做的。本人并不是做分子模拟的，但实验急需，还望各位大神给予指导和帮助，非常感谢！  |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 xuexijisuan |
» 猜你喜欢
参与限项
已经有5人回复
-
推荐一本书
已经有7人回复
-
有没有人能给点建议
已经有5人回复
-
假如你的研究生提出不合理要求
已经有12人回复
-
全日制（定向）博士
已经有5人回复
-
萌生出自己或许不适合搞科研的想法，现在跑or等等看？
已经有4人回复
-
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有4人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gromacs进行分子模拟时，pdb2gmx不认识小分子残基，怎么办，以及如何导入糖的力场
已经有8人回复
- 环己烷在gromacs中的gromos45a3力场中的itp文件怎么写？
已经有12人回复
- Gromacs中添加CHARMM力场
已经有41人回复
- Gromacs粗粒化力场（自己写）
已经有11人回复
- 离子液体模拟：如何从别的软件移植力场到Gromacs（itp文件的含义以及如何写itp文件）
已经有4人回复
- gromacs 添加新的力场pdb2gmx报错
已经有5人回复
- gromacs oplsaa 力场中的原子类型
已经有6人回复
- 求Gromacs中Glycam力场数据包。。非常感谢
已经有5人回复
- 【转帖】GROMACS分析程序讨论，在gromacs中添加Amber力场
已经有8人回复
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
2楼2015-05-12 00:18:28
3楼2015-05-12 09:23:36
声梦奇缘001
木虫 (正式写手)
- 应助: 56 (初中生)
- 金币: 5597.4
- 红花: 5
- 帖子: 614
- 在线: 218.7小时
- 虫号: 2406187
- 注册: 2013-04-07
- 专业: 化学工程及工业化学
4楼2015-05-12 09:45:59
|
本帖内容被屏蔽 |
5楼2015-09-22 20:01:37
hongyexi
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4967.4
- 帖子: 369
- 在线: 133.6小时
- 虫号: 381139
- 注册: 2007-05-24
- 性别: MM
- 专业: 物理化学
6楼2015-09-23 16:34:04
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
7楼2015-09-23 19:27:24
hongyexi
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4967.4
- 帖子: 369
- 在线: 133.6小时
- 虫号: 381139
- 注册: 2007-05-24
- 性别: MM
- 专业: 物理化学
8楼2015-09-23 21:06:58