应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何确定基因全长
61/1返回列表
查看: 2308  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pengqi

金虫 (初入文坛)

[求助] 如何确定基因全长 已有2人参与

求各位大神指点：
      
       本人目前已通过RACE克隆到该基因，但是不知道如何确定是否拿到该基因的全长序列。
      
       主要问题是现在不知如何确定RACE结果是否达到了3‘和5’的顶端，以及3‘UTR和5’UTR部分如何确定。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
坚持到底
1楼 2015-04-23 15:55:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

墨尔本机器

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个主要是通过Blast比对了，5UTR没有绝对的完整，比对不差太多都可以的，不必较真。3UTR一定要看到polyA。当然，自己的ORF一定要完整
赞一下 回复此楼
2楼2015-04-23 16:50:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ORF完整，BLAST分析是你要的序列，不用管3‘UTR和5’UTR是否完整。
赞一下 回复此楼
3楼2015-04-23 17:24:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happy_520

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 墨尔本机器 at 2015-04-23 16:50:52
这个主要是通过Blast比对了，5UTR没有绝对的完整，比对不差太多都可以的，不必较真。3UTR一定要看到polyA。当然，自己的ORF一定要完整

ORF BLAST比对是完整的，3‘端测序结果也有polyA，可是老师非要确定3'和5’UTR部分
赞一下 回复此楼
4楼2015-04-23 19:17:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

墨尔本机器

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by happy_520 at 2015-04-23 19:17:30
ORF BLAST比对是完整的，3‘端测序结果也有polyA，可是老师非要确定3'和5’UTR部分...

你通过比对告诉他完整就好了啊。
赞一下 回复此楼
5楼2015-04-24 10:12:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吕木木

新虫 (小有名气)
克隆全长基因全长序列时怎么设计引物啊

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2015-12-22 20:27:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pengqi 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭