查看: 3037  |  回复: 10

水-天一线

至尊木虫 (职业作家)

[求助] 不知道问题出在哪里,LAMMPS请大家帮我一下(附图片) 已有1人参与

我的目的是:
在一个半径为6.5,高为18.5的圆柱容器中pour 2300个球状颗粒(半径大小为0.5),
这些颗粒只受到重力影响。

我想要的结果是这样的:(可以忽略网格,只看颗粒)
不知道问题出在哪里,LAMMPS请大家帮我一下(附图片)

但是我得到的结果却是这样的:(可以忽略网格,只看颗粒)
不知道问题出在哪里,LAMMPS请大家帮我一下(附图片)-1

问题就出现了,为什么堆积效果不是我想要的结果呢?是不是颗粒之间的作用力需要做一定的限制呢?

这是生成颗粒堆积的代码:
atom_style        sphere
atom_modify     sort 0 0.0
boundary        ff ff ff   
newton                off        
communicate        single vel yes         

region          reg cylinder z 0 0 6.5 0.0 18.5 side in units box
create_box        1 reg

neighbor        0.2  bin   
neigh_modify         delay  0

timestep        0.001

fix                2 all gravity 10.0 spherical 0.0 -180.0  
fix                ins all pour 2300 1 230222 region reg diam one 0.5   

dump            ins all custom 1000 cylinder id x y z  
run             1000

我花在LAMMPS上的时间很长,但是一直都是一个人在瞎摸索,现在也不知道问题出在哪里,希望大家能够帮忙解答一下!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

★
水-天一线(月只蓝代发): 金币+1, 感谢指导 2015-01-27 21:39:25
看堆积后结果,是不是重力方向反了?另外的原子变得无序,是不是加上了温度?还有,请教一下,你的这个voronoi是用哪个程序算的?voro++吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-01-26 19:52:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水-天一线

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-01-26 19:52:33
看堆积后结果,是不是重力方向反了?另外的原子变得无序,是不是加上了温度?还有,请教一下,你的这个voronoi是用哪个程序算的?voro++吗?

重力方向应该没错,虽然上面一部分非常紧密,但是中间却很松散。

原子虽然无序,但是我也没有添加温度。

我只是觉得原子之间的受力是不是要考虑进去?

voronoi是用voro++算的。
3楼2015-01-26 19:58:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 水-天一线 at 2015-01-26 19:58:43
重力方向应该没错,虽然上面一部分非常紧密,但是中间却很松散。

原子虽然无序,但是我也没有添加温度。

我只是觉得原子之间的受力是不是要考虑进去?

voronoi是用voro++算的。...

没看到你的势函数是如何加上的

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-01-26 21:19:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水-天一线

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by abinitio at 2015-01-26 21:19:29
没看到你的势函数是如何加上的
...

的确,我没有添加势函数,我只是用了一句“fix    2 all gravity 10.0 spherical 0.0 -180.0  ”。
其实我想表达的意思是:
我想用lammps模拟现实的颗粒堆积过程,好比把N个大小一样的球放到固定尺寸的圆柱容器中,每个球体与周围球体都是相互接触的。

由于原本不是学这块内容的,所以不清楚怎么设置这方面的参数。
5楼2015-01-26 21:38:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

求问,你是怎样把lammps程序可视化的啊?我是在学新手,不太了解这些
你若盛开清风自来
6楼2015-01-28 16:02:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 水-天一线 at 2015-01-26 21:38:45
的确,我没有添加势函数,我只是用了一句“fix    2 all gravity 10.0 spherical 0.0 -180.0  ”。
其实我想表达的意思是:
我想用lammps模拟现实的颗粒堆积过程,好比把N个大小一样的球放到固定尺寸的圆柱容器中 ...

这方面我也没试过,你的想法是只利用重力场作用?
我感觉也应该把原子 之间的相互作用势加上,这样才能让原子相互之间达到最密堆积。如果没有明确的原子 ,是否可以用lj势的形式,构建一个模型?
7楼2015-01-28 19:18:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水-天一线

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 沫水abc at 2015-01-28 16:02:22
求问,你是怎样把lammps程序可视化的啊?我是在学新手,不太了解这些

可以用dump指令,里面有相应的内容。
8楼2015-01-29 19:22:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水-天一线

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by abinitio at 2015-01-28 19:18:15
这方面我也没试过,你的想法是只利用重力场作用?
我感觉也应该把原子 之间的相互作用势加上,这样才能让原子相互之间达到最密堆积。如果没有明确的原子 ,是否可以用lj势的形式,构建一个模型?...

对的。做一个类比吧:在地面上的一个圆柱形容器中,我倒入N个乒乓球,然后等待乒乓球静止不动了。我得到了每个乒乓球的中心坐标。
其实我就想用LAMMPS做一个这样的事,因为只需要考虑重力作用,所以我觉得这样应该在分子动力学中比较简单吧。
至于选用什么样的原子,我也不清楚,而且原子之间的作用势具体设置多少我也没想过。
9楼2015-01-29 19:27:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
水-天一线: 金币+9, ★★★★★最佳答案, 谢谢! 2015-02-01 09:46:01
引用回帖:
9楼: Originally posted by 水-天一线 at 2015-01-29 19:27:47
对的。做一个类比吧:在地面上的一个圆柱形容器中,我倒入N个乒乓球,然后等待乒乓球静止不动了。我得到了每个乒乓球的中心坐标。
其实我就想用LAMMPS做一个这样的事,因为只需要考虑重力作用,所以我觉得这样应该 ...

我是这样理解的,所谓分子动力学,一定要让分子动起来,而分子动起来的动力是相互作用势。至于lammps中的gravity是否提供了一个动力我不得而知,但从fix 的命令来看,似乎是不可能的。

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2015-01-29 22:02:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 水-天一线 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +6 Isak0320 2026-10-12 9/450 2026-10-12 21:13 by Isak0320
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +4 wangyl_123 2026-10-10 8/400 2026-10-12 18:09 by wangyl_123
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +3 好运来~9527 2026-10-10 6/300 2026-10-12 14:55 by 简单化xn
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见