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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps得出的应力张量如何可视化？
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dyc_2008

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[求助] lammps得出的应力张量如何可视化？ 已有1人参与

lammps是可以通过 compute stress/atom 来计算各个原子的应力的。通过dunp，可以把这个应力信息输出到文件。按道理说，应该可以对应力场进行可视化。但是应力张量，有6个分量，可视化好难啊。

哪位大侠有做个这种图啊

感激不尽
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一布福田，二修菩提
1楼 2014-02-25 21:11:48
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

werkstoff

银虫 (初入文坛)
★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-02-28 18:22:12
不需要的，就是你每个原子的PXX PYY PZZ的输出值除以原子体积。

我想你做力学单位应该是METAL，所以体积默认单位就是A3， 你PXX的输出值的单位是 BarA3

我举个例子，好比PXX=1000， 单位是BAR， 然后原子体积假定BCC的铁，晶格常数2.87，原子体积就是
2.87^3/2，最后你需要的值是 1000/（2.87^3/2)/10000， 最后那个10000从Bar写到GPa,
PYY, PZZ都照做以后， 加起来取负除以3，就可以PLOT了。

如果你算VON MIESE，上面也适用PXY， PYZ和PXZ，就是公式复杂点

够清楚了吧，希望可以帮到你
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5楼2014-02-28 17:11:01
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werkstoff

银虫 (初入文坛)
★ ★ ★
月只蓝: 金币+3, 鼓励交流！ 2014-02-28 08:16:53
不难的，你可视化应力无非是hydrostatical 或者是 von Mises
正应力 hydro. 就是 -([1]+[2]+[3])/3, 这个应力引起体积变化的
von Miese 的稍微长一点 , 看这个
http://kbs.cnki.net/forums/25971/ShowThread.aspx，等效应力

但是我要提醒你的是，LAMMPS算出的STRESS/ATOM 不是p, 而是pV.
对于每个原子来说V就是原子体积  a^3/(nr of the atom in unit lattice). a是晶格常数。
如果你晶格变化不大还OK，但是如果出现缺陷，那一块的V是无法定义的，只能近似地使用上面的公式。
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2楼2014-02-27 18:11:38
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普通回帖

werkstoff

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
dyc_2008: 金币+200, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2014-02-28 07:27:03
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-28 18:21:59
也就是说，你最后要输出的就一个值
要么你的正应力 （hys.)
要么等效应力 （von Miese).
取决于你要说明什么，和体积变化相关的用HYS，考虑切应力作用的用等效应力
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3楼2014-02-27 18:27:37
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dyc_2008

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by werkstoff at 2014-02-27 18:27:37
也就是说，你最后要输出的就一个值
要么你的正应力 （hys.)
要么等效应力 （von Miese).
取决于你要说明什么，和体积变化相关的用HYS，考虑切应力作用的用等效应力

我是力学盲。关于这个正应力，= -([1]+[2]+[3])/3不。
用这个公式前
要将张量【也就是矩阵】对角化不？
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一布福田，二修菩提
4楼2014-02-28 07:27:04
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jinhuangse

新虫 (初入文坛)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-28 20:30:22
楼主，我刚接触lammps，有个问题想问下，就是lammps的输入文件你是用什么软件编写的，lammps本身就能编写输入文件么？还有就是，如果我要修改它本身的例子，应该在哪修改，是不是需要别的软件来编辑呢？楼主有时间的话希望能够回复一下，谢谢！
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6楼2014-03-19 22:00:51
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dyc_2008

捐助贵宾 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+5, 感谢分享研究心得！ 2014-03-28 20:30:39
引用回帖:
6楼: Originally posted by jinhuangse at 2014-03-19 22:00:51
楼主，我刚接触lammps，有个问题想问下，就是lammps的输入文件你是用什么软件编写的，lammps本身就能编写输入文件么？还有就是，如果我要修改它本身的例子，应该在哪修改，是不是需要别的软件来编辑呢？楼主有时间的 ...

我模拟的晶体，原子排布规律性很强，所以
先用
creat region
把我的box分成若干个区域
然后定义一个
lattice
再就是用
create atom
目的是用刚刚这个lattice填充我们定义的region

如此重复，就可以构建出诸如晶界等缺陷，新定义一个region后，一般都要定义一个新的lattice，以覆盖以前的定义。这样才能使我们的box中包含两种及其以上的晶格类型。

无机非晶机有机分子的定义要难些，我没接触过，所以无法给你描述过程
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一布福田，二修菩提
7楼2014-03-20 08:47:23
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jinhuangse

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by dyc_2008 at 2014-03-20 08:47:23
我模拟的晶体，原子排布规律性很强，所以
先用
creat region
把我的box分成若干个区域
然后定义一个
lattice
再就是用
create atom
目的是用刚刚这个lattice填充我们定义的region

如此重复，就可以构建 ...

谢谢楼主的回答，我的意思不是说要怎么建立模型，我的意思是：lammps运行的时候读入in.name文件里的命令，就是这in.name文件是怎么生成的，手册上说的是text file ，咱们把命令都写好了，不是需要做成像examples里面的那些例子里面的in.name之类的文件才能够运行吗，我是说这个怎么做，还劳烦您帮忙指点下，谢谢~
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8楼2014-03-20 11:46:42
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werkstoff

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
月只蓝: 金币+3, 应助指数+1, 鼓励交流！ 2014-03-28 20:31:05
引用回帖:
8楼: Originally posted by jinhuangse at 2014-03-20 11:46:42
谢谢楼主的回答，我的意思不是说要怎么建立模型，我的意思是：lammps运行的时候读入in.name文件里的命令，就是这in.name文件是怎么生成的，手册上说的是text file ，咱们把命令都写好了，不是需要做成像examples里 ...

哈哈，楼主都不知道怎么回答你了 ...

用VIM 或者 GEDIT， 随便什么文本编辑器， 然后写好，保存为 in.name, 或者随便什么名字， 什么name.txt 啊， 1234 啊，都可以。 IN只是告诉你这是个输入文件

然后 ./lmp_serial < in.name

就好了
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9楼2014-03-27 18:28:16
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liuao1234aaa

捐助贵宾 (初入文坛)
打扰一下，给为大神，为什么我在运行compute  stress/atom  时候   提示错误啊，我用的是tersoff势函数，si和c的，好纠结
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10楼2016-01-22 00:17:14
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