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sbxlz3

新虫 (小有名气)

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[求助] 片段重复计算已有1人参与

请问有用过PLANT GENOME DUPLICATION DATABASE(PGDD)，
我做了基因的染色体定位，统计了串联，还需要计算片段重复。文献中说要用PGDD,（http://chibba.agtec.uga.edu/duplication/index/blast），但是不知什么原因不工作。

片段重复计算

片段重复.jpg

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1楼 2014-12-31 03:38:36

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titus0805

铁虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sbxlz3: 金币+5, 不是我要的答案，不过谢谢 2014-12-31 10:04:57

这个是查你的基因序列中有没有和基因组中重复序列相似度很高的，如果没有定位在染色体上才有意义。
把你的序列整理成fasta格式，在网站一跑不就知道了

2楼2014-12-31 08:17:46

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