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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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sbxlz3

新虫 (小有名气)

[求助] 片段重复计算 已有1人参与

请问有用过PLANT GENOME DUPLICATION DATABASE(PGDD),
我做了基因的染色体定位,统计了串联,还需要计算片段重复。文献中说要用PGDD,(http://chibba.agtec.uga.edu/duplication/index/blast),但是不知什么原因不工作。

片段重复计算
片段重复.jpg
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sbxlz3: 金币+5, 不是我要的答案,不过谢谢 2014-12-31 10:04:57
这个是查你的基因序列中有没有和基因组中重复序列相似度很高的,如果没有定位在染色体上才有意义。
把你的序列整理成fasta格式,在网站一跑不就知道了
2楼2014-12-31 08:17:46
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