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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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hukun100

木虫 (正式写手)

[求助] 寻找一个（些）数据库，当检索一个化学结构片段，可返回结构中含该片段的所有药物 已有4人参与

如题，请问诸位大神是否知道一些这样的数据库，比如我在检索框里面画一个呋喃环，即可以检索出来化学结构中含有呋喃环片段的所有药物！

目前我知道一个加拿大的网站（drugbank）有这项功能（http://www.drugbank.ca/），通过其ChemQuery Search by structure的功能，可以达到我要求的目的（如附图），但是其数据库目前仅有 7739种药物（且其中仅1584为 FDA-approved small molecule drugs）

另外，汤森路透的world-drug-index（http://thomsonreuters.com/world-drug-index/）里面的Metadrug以及Integrity貌似有非常强大的功能（貌似比我要求的功能要高大上的多）！有权限或是使用过的虫友能否麻烦简要介绍一下，非常感谢！

请各位大神不吝赐教啊！

寻找一个（些）数据库，当检索一个化学结构片段，可返回结构中含该片段的所有药物

寻找一个（些）数据库，当检索一个化学结构片段，可返回结构中含该片段的所有药物-1
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1楼 2014-08-07 21:08:30
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

gujinwang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hukun100: 金币+8, ★有帮助 2014-08-08 10:12:41
xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2014-08-08 14:00:25
scifinder可以比较全的给出含该片段的化合物，但是否为上市的药物，则需自己判断了吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2014-08-07 22:58:30
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普通回帖

乘风牧云

木虫 (职业作家)

--
★
xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2014-08-08 14:00:08
坤哥，上次SCIfinder来培训说一个碎片可以直接检索到所有相关的化合物信息，不过可能是针对合成的会稍微多一些，不知道这信息对你有用么
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hukun100
乘长风以牧青云
2楼2014-08-07 22:16:30
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)

风雪

优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hukun100: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-08-08 10:13:08
xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2014-08-08 14:00:17
Ccifinder 亚结构检索，找到每个物质的CAS号码，看其是否为药。
Integrity 有的，但搜索出来的是包括研发各个阶段的药物，当然上市的也包括在内的

world-drug-index 没权限，应该很好地 ，看这名字起的
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hukun100
3楼2014-08-07 22:26:22
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)

风雪

优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
drugbank数据库目前仅有 7739种药物，均为目前已经上市的药物吗？
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4楼2014-08-07 22:29:33
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cuitianzeng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hukun100: 金币+8, ★★★很有帮助 2014-08-08 10:14:19
xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2014-08-08 14:00:37
Pubchem  可以的 免费的
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6楼2014-08-08 08:21:46
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hukun100

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 乘风牧云 at 2014-08-07 22:16:30
坤哥，上次SCIfinder来培训说一个碎片可以直接检索到所有相关的化合物信息，不过可能是针对合成的会稍微多一些，不知道这信息对你有用么

SCIfinder的确是一种办法，但返回的结果肯定非常多！其实我只是希望通过这种办法来指导活性筛选，还在摸索之中，不知道有没有意义！
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7楼2014-08-08 10:04:11
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hukun100

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by baiyuefei at 2014-08-07 22:26:22
Ccifinder 亚结构检索，找到每个物质的CAS号码，看其是否为药。
Integrity 有的，但搜索出来的是包括研发各个阶段的药物，当然上市的也包括在内的

world-drug-index 没权限，应该很好地 ，看这名字起的

谢谢版主，那我再试试scifinder，看怎样能得到想要的检索结果！
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8楼2014-08-08 10:07:25
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hukun100

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by baiyuefei at 2014-08-07 22:29:33
drugbank数据库目前仅有 7739种药物，均为目前已经上市的药物吗？

这个是数据库的简介：
DrugBank Version 4.1
The DrugBank database is a unique bioinformatics and cheminformatics resource that combines detailed drug (i.e. chemical, pharmacological and pharmaceutical) data with comprehensive drug target (i.e. sequence, structure, and pathway) information. The database contains 7739 drug entries including 1584 FDA-approved small molecule drugs, 156 FDA-approved biotech (protein/peptide) drugs, 89 nutraceuticals and over 6000 experimental drugs. Additionally, 4283 non-redundant protein (i.e. drug target/enzyme/transporter/carrier) sequences are linked to these drug entries. Each DrugCard entry contains more than 200 data fields with half of the information being devoted to drug/chemical data and the other half devoted to drug target or protein data.
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9楼2014-08-08 10:08:41
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hukun100

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by gujinwang at 2014-08-07 22:58:30
scifinder可以比较全的给出含该片段的化合物，但是否为上市的药物，则需自己判断了吧

好的，谢谢，我再摸索一下这种方法吧！
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10楼2014-08-08 10:12:24
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