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hukun100

木虫 (正式写手)

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[求助] 寻找一个（些）数据库，当检索一个化学结构片段，可返回结构中含该片段的所有药物已有4人参与

如题，请问诸位大神是否知道一些这样的数据库，比如我在检索框里面画一个呋喃环，即可以检索出来化学结构中含有呋喃环片段的所有药物！

目前我知道一个加拿大的网站（drugbank）有这项功能（http://www.drugbank.ca/），通过其ChemQuery Search by structure的功能，可以达到我要求的目的（如附图），但是其数据库目前仅有 7739种药物（且其中仅1584为 FDA-approved small molecule drugs）

另外，汤森路透的world-drug-index（http://thomsonreuters.com/world-drug-index/）里面的Metadrug以及Integrity貌似有非常强大的功能（貌似比我要求的功能要高大上的多）！有权限或是使用过的虫友能否麻烦简要介绍一下，非常感谢！

请各位大神不吝赐教啊！

寻找一个（些）数据库，当检索一个化学结构片段，可返回结构中含该片段的所有药物-1

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1楼 2014-08-07 21:08:30

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hukun100

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引用回帖:

4楼: Originally posted by baiyuefei at 2014-08-07 22:29:33
drugbank数据库目前仅有 7739种药物，均为目前已经上市的药物吗？

这个是数据库的简介：
DrugBank Version 4.1
The DrugBank database is a unique bioinformatics and cheminformatics resource that combines detailed drug (i.e. chemical, pharmacological and pharmaceutical) data with comprehensive drug target (i.e. sequence, structure, and pathway) information. The database contains 7739 drug entries including 1584 FDA-approved small molecule drugs, 156 FDA-approved biotech (protein/peptide) drugs, 89 nutraceuticals and over 6000 experimental drugs. Additionally, 4283 non-redundant protein (i.e. drug target/enzyme/transporter/carrier) sequences are linked to these drug entries. Each DrugCard entry contains more than 200 data fields with half of the information being devoted to drug/chemical data and the other half devoted to drug target or protein data.