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hukun100

木虫 (正式写手)


[求助] 寻找一个(些)数据库,当检索一个化学结构片段,可返回结构中含该片段的所有药物 已有4人参与

如题,请问诸位大神是否知道一些这样的数据库,比如我在检索框里面画一个呋喃环,即可以检索出来化学结构中含有呋喃环片段的所有药物!

目前我知道一个加拿大的网站(drugbank)有这项功能(http://www.drugbank.ca/),通过其ChemQuery Search by structure的功能,可以达到我要求的目的(如附图),但是其数据库目前仅有 7739种药物(且其中仅1584为 FDA-approved small molecule drugs)

另外,汤森路透的world-drug-index(http://thomsonreuters.com/world-drug-index/)里面的Metadrug以及Integrity貌似有非常强大的功能(貌似比我要求的功能要高大上的多)!有权限或是使用过的虫友能否麻烦简要介绍一下,非常感谢!

请各位大神不吝赐教啊!

寻找一个(些)数据库,当检索一个化学结构片段,可返回结构中含该片段的所有药物

寻找一个(些)数据库,当检索一个化学结构片段,可返回结构中含该片段的所有药物-1
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hukun100

木虫 (正式写手)


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引用回帖:
2楼: Originally posted by 乘风牧云 at 2014-08-07 22:16:30
坤哥,上次SCIfinder来培训说一个碎片可以直接检索到所有相关的化合物信息,不过可能是针对合成的会稍微多一些,不知道这信息对你有用么

SCIfinder的确是一种办法,但返回的结果肯定非常多!其实我只是希望通过这种办法来指导活性筛选,还在摸索之中,不知道有没有意义!
7楼2014-08-08 10:04:11
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查看全部 27 个回答

乘风牧云

木虫 (职业作家)

--


xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2014-08-08 14:00:08
坤哥,上次SCIfinder来培训说一个碎片可以直接检索到所有相关的化合物信息,不过可能是针对合成的会稍微多一些,不知道这信息对你有用么

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

乘长风以牧青云
2楼2014-08-07 22:16:30
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)

风雪

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
hukun100: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-08-08 10:13:08
xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2014-08-08 14:00:17
Ccifinder 亚结构检索,找到每个物质的CAS号码,看其是否为药。
Integrity 有的,但搜索出来的是包括研发各个阶段的药物,当然上市的也包括在内的

world-drug-index 没权限,应该很好地 ,看这名字起的

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-08-07 22:26:22
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)

风雪

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drugbank数据库目前仅有 7739种药物,均为目前已经上市的药物吗?
4楼2014-08-07 22:29:33
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